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标题: 过渡态、IRC做出来的反应物和产物都关于同一个Cs平面对称 [打印本页]

作者
Author: zc000 时间: 2018-5-20 21:39
标题: 过渡态、IRC做出来的反应物和产物都关于同一个Cs平面对称
Sob老师，我做了一个反应，将两个分子（AO和BCl）放在一块生成稳定的中间体M(BOACl)，然后寻找过渡态，进而做IRC分析，发现虚频震动和优化后两个产物也是关于同一个Cs平面对称（其中一个产物是中间体M），我做这个反应的初衷是想生成两个新的分子（ACl和BO），不知道我的问题表达清楚没有，望老师有空解答一下。

作者
Author: zc000 时间: 2018-5-21 20:18
本帖最后由 zc000 于 2018-5-21 20:20 编辑

可能我的表达有一些问题，我在做计算的时候，过渡态IRC对应的两个产物是两个“手性”分子，两个分子关于过渡态对称面对称，下图是IRC图

作者
Author: sobereva 时间: 2018-5-23 13:25
描述太抽象。光看你的IRC图，当前找的过渡态貌似对应两个手性异构体之间的异构化，没找到真正对应化学反应的过渡态，还得尝试其它过渡态初猜

作者
Author: zc000 时间: 2018-5-26 15:13

sobereva 发表于 2018-5-23 13:25
描述太抽象。光看你的IRC图，当前找的过渡态貌似对应两个手性异构体之间的异构化，没找到真正对应化学反应 ...

IRC走出来两边对称。下图分别是过渡态和反应物、产物的图片。过渡态有个对称平面、虚频震动关于同一个对称平面对称、连接虚频震动的反应物、产物分子关于同一个对称平面对称

作者
Author: sobereva 时间: 2018-5-26 17:08
你这个不是反应的过渡态，只不过是一个结合体的构型转变的过渡态，而且前后结构互为手性，因此IRC肯定是对称的
如果要找对应化学反应的过渡态得重新提供其它过渡态初猜结构

作者
Author: zc000 时间: 2018-5-26 21:48

sobereva 发表于 2018-5-26 17:08
你这个不是反应的过渡态，只不过是一个结合体的构型转变的过渡态，而且前后结构互为手性，因此IRC肯定是对 ...

明白了，虽然这个结构有一个虚频，却不是一个正确的过渡态。是这个意思吧，老师！

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Author: sobereva 时间: 2018-5-27 00:10

zc000 发表于 2018-5-26 21:48
明白了，虽然这个结构有一个虚频，却不是一个正确的过渡态。是这个意思吧，老师！

不是不正确，这是一个常规意义的过渡态，但不是对应于你要研究的化学反应的过渡态

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Author: zc000 时间: 2018-5-27 08:42

sobereva 发表于 2018-5-27 00:10
不是不正确，这是一个常规意义的过渡态，但不是对应于你要研究的化学反应的过渡态

明白了，老师，谢谢您！

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