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标题: IRC反应物和理想不一致如何解决 [打印本页]

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Wind_runner    时间: 2018-5-22 23:01
标题: IRC反应物和理想不一致如何解决
file:///C:/Users/zhongshengguang/AppData/Roaming/Tencent/Users/593367432/TIM/WinTemp/RichOle/)I_EZE6$H%7DW7B%7D(SR4$)%25SC.png
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第一幅图  反应物  将CO2和甲基拉近猜测过渡态
第二幅图  过渡态
第三幅图  IRC
第四幅图  IRC最左边一帧,已经非常平行接近反应物了   
IRC猜的反应物和初始用来猜测过渡态的差别非常大,请问是什么问题?

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sobereva    时间: 2018-5-23 12:29
那不叫“IRC猜的反应物”,而是走IRC,得到的与实际找出来的过渡态连通的反应物。当前称不上有什么异常
从找出来的过渡态结构看,就和第一幅图存在极为显著的不同
对IRC反应物那一端的点用较小步长上限进行优化,如果和预期的反应物不同,就说明预期的不对,或者和这个过程的反应物之间还有别的过程。

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Xx_DerEnTh    时间: 2025-1-23 11:43
sobereva 发表于 2018-5-23 12:29
那不叫“IRC猜的反应物”,而是走IRC,得到的与实际找出来的过渡态连通的反应物。当前称不上有什么异常
从 ...

sob老师您好,在此借楼请教一下,“如果和预期的反应物不同”这句话具体是怎么判断呢?是跑完IRC后优化端点,然后肉眼观察当前结构的成键是否符合预期吗?但是gview里面显示的成键又不能作为判断依据,还是说有具体的操作步骤判断IRC得到的反应物/产物是否符合预期呢?谢谢老师!
作者
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sobereva    时间: 2025-1-23 11:59
Xx_DerEnTh 发表于 2025-1-23 11:43
sob老师您好,在此借楼请教一下,“如果和预期的反应物不同”这句话具体是怎么判断呢?是跑完IRC后优化端 ...

看根据原子间距离、相对位置,凭化学直觉就知道(没基本直觉的话,看看结构化学书里的结构)
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Xx_DerEnTh    时间: 2025-1-23 12:15
sobereva 发表于 2025-1-23 11:59
看根据原子间距离、相对位置,凭化学直觉就知道(没基本直觉的话,看看结构化学书里的结构)

好的,谢谢sob老师




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