计算化学公社

标题: MOL 文件内容的含义 [打印本页]

作者
Author: luktian 时间: 2018-5-24 10:39
标题: MOL 文件内容的含义
公社的前辈们好，新人想问下mol文件里的每行的含义可以在哪里找到？搜百度、谷歌、公社里都没有想要的结果。主要是用于将大批量的opt的log文件转化成.mol文件的目的，数量太多，用GV一个个转太慢，想用其他语言写个脚本批量转一下。
先谢谢各位前辈的指导！

作者
Author: 让你变成回忆 时间: 2018-5-24 10:59
Multiwfn（比较新的版本）直接支持mol文件（由于不包含基函数等信息，因此不能够用于一些波函数分析，仅仅只能够用于一些只与分子结构有关的分析），你可以看源代码中是如何读取mol文件应该就能对mol文件格式有详细了解了。
PS: 源代码文件具体在：fileIO.f90中的子程序readmol

作者
Author: sobereva 时间: 2018-5-24 11:13
https://en.wikipedia.org/wiki/Chemical_table_file
.mol就是指里面的V2000

作者
Author: luktian 时间: 2018-5-24 11:40

让你变成回忆发表于 2018-5-24 10:59
Multiwfn（比较新的版本）直接支持mol文件（由于不包含基函数等信息，因此不能够用于一些波函数分析，仅仅 ...

感谢前辈，我去看一下

作者
Author: luktian 时间: 2018-5-24 11:41

sobereva 发表于 2018-5-24 11:13
https://en.wikipedia.org/wiki/Chemical_table_file
.mol就是指里面的V2000

感谢sob老师

作者
Author: luktian 时间: 2018-5-24 11:44
补一下wiki里mol（V2000）文件的定义出处：doi:10.1021/ci00007a012

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