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标题: 配置服务器问题 [打印本页]

作者
Author: xiaomidaxue 时间: 2018-6-9 22:32
标题: 配置服务器问题
需要购买5台服务器用于组件计算集群，主要用于计算Gaussian和VASP等软件。由于钱有限，因此经过考虑和调查后得到如下配置：
服务器采用华为的二手服务器RH2288V2（只支持E5 2600V2系列CPU）的2U服务器准系统，大概2013年生产。配置有双电，原装双路主板，带阵列卡（可做raid 0,1,5），带有2个千兆网口。调查了这款服务器大概在2012年左右推出，性价比可行，主要是原装服务器运行比较稳定。
针对这款服务器，自己配置CPU和内存以及硬盘：
CPU：2680V2* 2 或者2690V2*2 不过2690V2价格较高，功耗也高。2680V2虽然是10核心，但是主频2.8GHZ，性能上比2680V3低20%左右（估计），但是性价比较高。2690V2虽然主频是3.0GHZ，但是功耗高，而且价格比2680V2贵30%，性价比不高。
内存：打算购买二手的DDR3 recc 8g 1333或者1600的内存条，配8条组成64GB。
硬盘：2T SAS 7.2K的硬盘（二手）3.5寸（2017年生产）；或者替换为480G的SSD（全新）。两者的价格差异不大。
请教一下我的配置是否比较合适，同时也请教一下专家和老师几个问题：
1、RH2288V2的2U服务器2013年产的，原装的准系统，是否稳定？是否比自己组装的塔式服务器稳定？主要是考虑到2U的刀片式用机柜好放置。另外组成集群是否一定要阵列卡，不做raid是否也可以？
2、2680V2*2 20核心的CPU是否用于高斯和vasp计算合适？性价比如何？由于不支持AVX2指令集，速度上是否会慢很多，大概慢多少？
3、DDR3 recc 8g的内存条选1333还是1600比较合适，内存的频率对于计算速度影响有多少？另外，二手的DDR3的1600的内存条12年生产的是否可以买，内存用久了是否会影响速度？DDR3对比DDR4计算速度是否会慢很多，大概会慢多少？
4、对于硬盘的话用于高斯和vasp计算是否有必要上SSD，SSD的速度相比7.2K的SAS快很多？SSD上480G是否合适，用于安装cent os系统和软件计算缓存？二手的SAS 7.2K的硬盘是否合适，硬盘的使用时间对于运算速度肯定有影响，但是不知道对于计算速度的影响有多少？
5、另外也想过上E5 2600V3系列的cpu，列如E5-2678V3的正式版，或者2680V3、2696V3的qs cpu。但是价格上面太贵，不知道对于2680V2系列提升有多大？
以上问题，可能涉及比较多，由于需要组服务器，考虑的比较多，也麻烦了。非常感谢！

作者
Author: zyzhang 时间: 2018-6-10 01:28
一般这种机架式服务器都是安装在空调机房，CPU、内存、主板这些不容易出问题，让人担心的是硬盘，毕竟7*24h转了五年了，数据无价，换块新的吧。要是白送，又舍不得让旧硬盘闲置，那就做个RAID1，多一份安心；通常情况下，机架式服务器要比自己组装的塔式机更稳定些，但这样的比较并不严格。机架式服务器一般都配有冗余电源，在电源稳定性方面会更胜一筹；但是，在散热方面，塔式服务器明显更优越，所以只能说各有利弊。另外自己组装也可以换成4U的工控机箱，这样可以顺利上架；还有你问20核心的CPU是否适用于高斯和vasp计算？这个问题很尴尬，我只能说一般计算20核也都够用；CPU方面v2系列不支持AVX2指令集，会慢20%左右；内存频率对计算速度影响不大，内存即使用久了也并不会影响速度，还有DDR3和DDR4的差别也不大；给你推荐老师的这两篇博文：
http://bbs.keinsci.com/thread-109-1-1.html
http://bbs.keinsci.com/thread-6310-1-1.html
SSD嘛你根据自己的计算需要取舍，去看这篇博文http://bbs.keinsci.com/thread-7478-1-1.html
另外，二手硬盘不是担心他的速度，速度不会有影响，担心的是它的寿命
最后一个问题，能买V3就不要选V2，V3性能有明显提升。

作者
Author: 一颗赛艇 时间: 2018-6-10 02:30
用经费买吗？头一次买服务器竟然还是二手？胆子好大呀

另外听说VASP对内存速度比较敏感

作者
Author: sobereva 时间: 2018-6-10 03:01
v2现在是白菜价，稍微好点的v3一颗U都顶v2一台整机。如果经费捉襟见肘，且卖家的v2老服务器价格确实便宜，买v2是很好选择，从性价比来说无疑远高于买v3新机子。
AVX2的问题相对来说不是那么关键，毕竟v2的性价比优势实在太明显，先用v2的老机子挺几年，等以后条件好了再买新机子，直接上AVX512了。

作者
Author: xiaomidaxue 时间: 2018-6-10 10:54

一颗赛艇发表于 2018-6-10 02:30
用经费买吗？头一次买服务器竟然还是二手？胆子好大呀

另外听说VASP对内存速度比较敏感

不是经费购买

作者
Author: xiaomidaxue 时间: 2018-6-10 10:55

sobereva 发表于 2018-6-10 03:01
v2现在是白菜价，稍微好点的v3一颗U都顶v2一台整机。如果经费捉襟见肘，且卖家的v2老服务器价格确实便宜， ...

谢谢老师，因为好多超算中心的设备都是V2的，极少数的有V3的。

作者
Author: xiaomidaxue 时间: 2018-6-10 10:59

zyzhang 发表于 2018-6-10 01:28
一般这种机架式服务器都是安装在空调机房，CPU、内存、主板这些不容易出问题，让人担心的是硬盘，毕竟7*24h ...

谢谢了，确实没钱。塔式占有地方。2U的其实我算过，2680V2 95w，2颗是190我，加上其他的满载不会超过250w。所以散热问题倒不是很大。
另外硬盘我觉得SSD的话可以买新的，480G在500左右；2T 的SAS 7.2K的也在550左右（二手库存）。主要是SSD的话容量不太够，新的寿命肯定没有问题。2T的硬盘容量够了，但是比较是二手库存。

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