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标题: 定域轨道函数（LOL）图像和坐标问题 [打印本页]

作者
Author: 853474282 时间: 2018-6-21 11:34
标题: 定域轨道函数（LOL）图像和坐标问题
首先想问一下，这个lol分析图的纵坐标是什么意思，有单位吗，是不是单纯的一个坐标距离？横坐标是每个原子之间的距离，那个色彩条指的是颜色越深（红），自旋密度越大，上边的数值是不是isosurface值？我分别将三重态，五重态和七重态下的Fe-O2组分进行了优化，得到的spin density 显示在三重态下Fe是三价的，五重态和七重态下Fe是二价的，我想问一下，三重态（左边，非圆形）下Fe投影下的形状为啥是方形的？感觉好别扭，七重态和五重态下都是圆形的。是不是Fe不同的价态对应的lol投影不同？
非常感谢解答！！

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作者
Author: sobereva 时间: 2018-6-21 11:58
注意求助帖应当在帖子标题末尾体现出提问、求助（见http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html），给你改了

作者
Author: sobereva 时间: 2018-6-21 12:04
纵坐标显然是函数值，单位就是你绘制的函数的单位

LOL和自旋密度毫无联系，不要把八竿子打不着的概念联系到一起去

这又不是等值面图，何来isosurface值？

自旋密度没法用于体现原子是几价的。怎么恰当判断看
使用Multiwfn通过LOBA方法计算氧化态
http://sobereva.com/362

搞清楚LOL的物理意义再去讨论，否则都是瞎讨论。看Multiwfn手册2.6节的介绍以及ELF相关资料（LOL和ELF的物理意义很大程度雷同）
ELF综述和重要文献小合集
http://bbs.keinsci.com/thread-2100-1-1.html

过渡金属原子附近LOL/ELF分布特征和原子的d电子分布有直接关系，d电子半满或全满占据才能确保ELF/LOL是球对称分布

作者
Author: 853474282 时间: 2018-6-21 14:51

sobereva 发表于 2018-6-21 12:04
纵坐标显然是函数值，单位就是你绘制的函数的单位

LOL和自旋密度毫无联系，不要把八竿子打不着的概念联 ...

哇，标题写的很抱歉，非常感谢sob老师！！解释的很清楚，受益匪浅！谢谢谢谢！！谢谢谢谢！

作者
Author: 853474282 时间: 2018-6-21 14:57

sobereva 发表于 2018-6-21 12:04
纵坐标显然是函数值，单位就是你绘制的函数的单位

LOL和自旋密度毫无联系，不要把八竿子打不着的概念联 ...

sob老师，我是通过计算每个原子的spin density（ Unpaired electrons from D(alpha)-D(beta)）得到的数值推算的，例如五重态得到的是4.03696，我推算五重态Fe上有4个未成对电子，也就是二价铁，这样分析不知可行否？

作者
Author: 853474282 时间: 2018-6-21 15:02

sobereva 发表于 2018-6-21 12:04
纵坐标显然是函数值，单位就是你绘制的函数的单位

LOL和自旋密度毫无联系，不要把八竿子打不着的概念联 ...

sob老师，我是通过Turbomole求出的spin density的值，我是做QM/MM的，谢谢sob老师

作者
Author: sobereva 时间: 2018-6-21 16:30

853474282 发表于 2018-6-21 14:57
sob老师，我是通过计算每个原子的spin density（ Unpaired electrons from D(alpha)-D(beta)）得到的数值 ...

那叫原子的spin population而不叫spin density，看
谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘制和计算
http://sobereva.com/353

你那种做法不十分严格

作者
Author: 853474282 时间: 2018-6-21 16:30

sobereva 发表于 2018-6-21 12:04
纵坐标显然是函数值，单位就是你绘制的函数的单位

LOL和自旋密度毫无联系，不要把八竿子打不着的概念联 ...

sob老师，您说的“过渡金属原子附近LOL/ELF分布特征和原子的d电子分布有直接关系，d电子半满或全满占据才能确保ELF/LOL是球对称分布” 指的是Fe的3d轨道必须是“ ↑↓ ↑↓ ↑↓ ↑↓ ↑↓” 和 “ ↑ ↑ ↑ ↑ ↑ ”时，电子定域函数分布特征图才是球对称分布的吗？如果3d轨道的电子排布是这样“ ↑↓ ↑ ↑ ↑ ↑ ”，这个投影阴影图也不会得到圆形。这是不是也意味着，当我的图显示圆形的时候，此时Fe的电子填充状态应该是“ ↑ ↑ ↑ ↑ ↑ ” 是三价？非常感谢sob老师！！

作者
Author: sobereva 时间: 2018-6-21 16:33

853474282 发表于 2018-6-21 16:30
sob老师，您说的“过渡金属原子附近LOL/ELF分布特征和原子的d电子分布有直接关系，d电子半满或全满占据才 ...

平面图仅仅是一个截面
实际分布是绕着Fe球对称分布的话，那么不管什么截面看总是圆形
而一个截面看是圆形，并不意味着真正是球对称分布

不建议从这上来判断
怎么判断氧化态我博文里已经说了

作者
Author: 853474282 时间: 2018-6-21 16:37

sobereva 发表于 2018-6-21 16:30
那叫原子的spin population而不叫spin density，看
谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘制和计 ...

sob老师，刚刚看了一下您发的链接，受益匪浅，我又看了一下输出脚本，的确是spin population，我概念混淆了。。。抱歉！谢谢sob老师！

作者
Author: 853474282 时间: 2018-6-21 16:42

sobereva 发表于 2018-6-21 16:33
平面图仅仅是一个截面
实际分布是绕着Fe球对称分布的话，那么不管什么截面看总是圆形
而一个截面看是圆 ...

嗯嗯嗯，理解了！谢谢sob老师！

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