计算化学公社

标题: 关于SOS计算超极化率的问题 [打印本页]

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cornerj    时间: 2018-6-26 17:42
标题: 关于SOS计算超极化率的问题
最近做第一超极化率的计算,碰到几个小问题,有点不明白,特来请教。
对于六十个原子左右(含CNHF)的共轭配合物体系,如果利用SOS方法计算其第一超极化率,选取CAM-B3LYP 泛函,按照培训讲义推荐的基组选用aug-cc-pVDZ。但是计算的体系中如若包含一个金属原子 In,似乎aug-cc-pVDZ并没有定义它,该换成什么基组?另外,对于不同的分子,结合Multiwfn计算出的β在偶极矩方向上的分量β||,有的是负值有的是正值比如-1000a.u.和300a.u.,这个正负号表示的是什么含义?如果是要比较其大小,是比较数值还是绝对值大小?
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sobereva    时间: 2018-6-26 22:55
用aug-cc-pVDZ-PP
谈谈赝势基组的选用
http://sobereva.com/373

根据超极化率导数形式的定义理解。比绝对值

PS:Multiwfn 3.5的SOS功能有bug,如果用的3.5,改用最新的3.6(dev)或3.5之前的版本

作者
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cornerj    时间: 2018-6-27 21:21
sobereva 发表于 2018-6-26 22:55
用aug-cc-pVDZ-PP
谈谈赝势基组的选用
http://sobereva.com/373

哦哦,好的谢谢老师!
我正是用的Multiwfn3.5版本计算的β值,那我重新计算一遍。
另,发现计算过程中生成S0S.txt文件这一步骤极度耗费时间,对于正在计算的体系,笔记本要跑三四十小时甚至更久才能完成,除了增大settings.ini中的nthreads,不知有没有其他加快生成文件速度的方法?
作者
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sobereva    时间: 2018-6-28 02:07
cornerj 发表于 2018-6-27 21:21
哦哦,好的谢谢老师!
我正是用的Multiwfn3.5版本计算的β值,那我重新计算一遍。
另,发现计算过程中 ...


我刚刚更新了主页上的3.6(dev)版,这个版本在生成SOS.txt的过程中把非常耗时的一步(产生分子轨道间的跃迁偶极矩)的耗时降低了甚巨,可以试试。如果还慢,那就只能用更小点基组,或者把IOp(9/40=x)的x设更小点(但不能小于3),代码已经没法进一步优化了。
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cornerj    时间: 2018-6-28 23:30
sobereva 发表于 2018-6-28 02:07
我刚刚更新了主页上的3.6(dev)版,这个版本在生成SOS.txt的过程中把非常耗时的一步(产生分子轨道间的 ...

十分感谢老师的指点!今天尝试了下用3.6(dev)版重新生成S0S.txt文件,速度快的飞起!太爽了!
大致耗时仅仅半小时至一小时而已,极度省时了!
麻烦再问点问题,对比了一下3.5版和3.6(dev)版得到的数据,对于同样的.fch和.log文件,体系的极化率α数值是可重现的,一模一样,
但β|| 的数值却有较大差别,如有略微增大几百a.u.的,也有暴减的,从之前+300a.u.变为-20a.u,对这个变化很是疑惑,不知是何原因?
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sobereva    时间: 2018-6-29 00:12
cornerj 发表于 2018-6-28 23:30
十分感谢老师的指点!今天尝试了下用3.6(dev)版重新生成S0S.txt文件,速度快的飞起!太爽了!
大致耗 ...

3.5版的alpha没问题,beta和delta是错的
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cornerj    时间: 2018-6-29 19:40
sobereva 发表于 2018-6-29 00:12
3.5版的alpha没问题,beta和delta是错的

明白了!谢谢老师!




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