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标题: gaussian09两步计算出现报错 [打印本页]

作者
Author: xaomidaxue 时间: 2018-7-4 22:34
标题: gaussian09两步计算出现报错
本帖最后由 xaomidaxue 于 2018-7-5 08:23 编辑

gaussian09的gjf文件设置为两步计算：第一步进行opt+freq，第二步进行UV吸收计算（具体见附件gjf文件）
%chk=B-DpaCh-15.chk
%mem=30GB
%nprocshared=24
# opt freq b3lyp/6-31g(d)

s0 opt

0 1

坐标

--link1--
%chk=B-DpaCh-15.chk
%mem=20GB
%nprocshared=28
#p td=(50-50,nstates=6) b3lyp/6-31g(d) geom=check guess=read

S1 T1 calculation

0 1

结果log文件出现如下错误如下：具体见附件log文件
Structure from the checkpoint file: "/THFS/home/test7/scratch/Gau-2989.chk"
FileIO operation on non-existent file.

Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO

请教一下这是什么原因导致的，这是在超算中心出现的问题，自己的设备可以计算完成不会出现第二步的错误。（另外附上超算的脚本文件a.sh和g09_sub，a.sh执行运算时会调用g09_sub）
谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2018-7-5 04:07
(, 下载次数 Times of downloads: 29)

已经把你上传到的过大的未压缩的log删了

作者
Author: sobereva 时间: 2018-7-5 04:08
之前的chk已经没了，或者执行计算的不是同一台机子，找不到chk所致

作者
Author: xaomidaxue 时间: 2018-7-5 08:23

sobereva 发表于 2018-7-5 04:07
已经把你上传到的过大的未压缩的log删了

好的，我已经压缩了log文件

作者
Author: xaomidaxue 时间: 2018-7-5 08:25

sobereva 发表于 2018-7-5 04:08
之前的chk已经没了，或者执行计算的不是同一台机子，找不到chk所致

谢谢，但是自己的集群上就没有这种情况，同一个gjf文件应该是当2步都计算完毕成功后才会删除chk文件吧。是否是我的脚本文件出现问题？

作者
Author: sobereva 时间: 2018-7-5 08:30
只要定义了%chk而且没用nosave，就不会自动删

作者
Author: sobereva 时间: 2018-7-5 08:35
chk用绝对路径再试

作者
Author: xaomidaxue 时间: 2018-7-5 11:41
本帖最后由 xaomidaxue 于 2018-7-5 11:48 编辑

sobereva 发表于 2018-7-5 08:35
chk用绝对路径再试

我检查了scratch中是有Gau-2989.chk这个文件的
老师，您的意思是用绝对路径，是用生成的B-DpaCh-15.chk的路径还是中间生成文件Gau-2989.chk的路径？这两个路径不同是否是gaussian软件第二步运算的时候没有权限读取"/THFS/home/test7/scratch/Gau-2989.chk"中的Gau-2989.chk文件

谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2018-7-5 11:57
两处B-DpaCh-15.chk都写成绝对路径

作者
Author: xaomidaxue 时间: 2018-7-5 12:36

sobereva 发表于 2018-7-5 11:57
两处B-DpaCh-15.chk都写成绝对路径

谢谢老师，按照您的方法已经解决，谢谢

作者
Author: houxudong2020 时间: 2020-6-26 15:27
本帖最后由 houxudong2020 于 2020-6-26 16:14 编辑

老师您好，我也出现了上面相同的错误，使用了绝对路径后，依然报错。我使用的是课题组的计算集群，内存是够的。求问原因

谢谢老师，我已经解决了。把onlyinput删除掉就行了。

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