计算化学公社

标题: 如何得到一个比较好的构型 [打印本页]

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w_hui33299    时间: 2015-5-4 16:08
标题: 如何得到一个比较好的构型
如题。不断的优化,找到最低的能量就够了吗?

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小范范1989    时间: 2015-5-4 17:39
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=600
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=577
两位大神的帖子,可以看看,收获颇多
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sobereva    时间: 2015-5-5 01:15
具体要看是什么体系以及要研究什么问题。
虽然大多数时候感兴趣的是能量最低构型,但往往也需要考察其它相对稳定的极小点构型,这需要手动尝试不同初猜,或者用一些程序做构象/构型搜索。比如molclus可以用于搜索分子团簇构型。
还要考虑用的计算方法是否合理。
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lastzealot    时间: 2015-5-10 20:15
sobereva 发表于 2015-5-5 01:15
具体要看是什么体系以及要研究什么问题。
虽然大多数时候感兴趣的是能量最低构型,但往往也需要考察其它相 ...

sob大神,我也很想知道如何才能得到一个团簇的最稳构型。我看了你写的那个帖子“使用molclus程序做分子团簇构型搜索和分子构象搜索”,molclus是基于分子动力学软件。可是我不会任何分子动力学软件,只是经常使用高斯。
请问能否推荐个适合我的找最低构型的方法?
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sobereva    时间: 2015-5-10 20:35
没有什么更好的办法,如果不用molclus或其它的构型搜索的程序,你只能自己手动去摆各种朝向作为初猜,这又麻烦又容易遗漏。
作者
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ccccn345    时间: 2017-12-1 06:59
小范范1989 发表于 2015-5-4 17:39
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=600
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewth ...


你好,这两个连接打不开了,可以再发一下吗,谢谢
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Mikasa    时间: 2017-12-1 07:30
ccccn345 发表于 2017-12-1 06:59
你好,这两个连接打不开了,可以再发一下吗,谢谢

http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=600
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=577
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ccccn345    时间: 2017-12-2 02:30
Mikasa 发表于 2017-12-1 07:30
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http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=view ...

谢谢




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