计算化学公社
标题: 高斯多步任务计算输入文件书写格式求助 [打印本页]
作者Author: 风飞 时间: 2018-7-18 02:43
标题: 高斯多步任务计算输入文件书写格式求助
老师，您好！
抱歉我这次没有去试过，我在手册上看到高斯运算的多步文件的书写格式，所以猜想是否可以这样书写，想麻烦老师您指点一下，
高斯手册中多步任务的书写如图1，于是我仿造写了TS和IRC两个任务计算的文件，如图2，请问这样写是否正确呢？（我比高斯手册例子少写了Geom=Check，是不是要把Geom=Check Guess=Read都写进去呢？ ）TS和IRC计算有一定先后顺序（计算完TS，根据TS所找到的过渡态结构计算对应的IRC），请问如果这两个任务并没有关联性，例如优化A分子，在优化B分子，这时，多步任务的书写是否是这样的呢？如图3
可以在冒昧的问一下，Geom=Check Guess=Read的分别是什么意思吗？，
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作者Author: liyuanhe211 时间: 2018-7-18 06:35
本帖最后由 liyuanhe211 于 2018-7-18 12:15 编辑
“抱歉没有试过”为什么不试？有打那么多字的时间（以及拿画笔一行一行涂那半天）换个小分子的任务及过渡态早就试完了，分文件运行和多步计算的输出文件一对比马上就知道。都有人一字一句把手册翻译成中文给你了，是还要把Geom=Check Guess=Read的含义复制粘贴过来才看？
用--link1--和分成两个任务先后连续运行没有区别。
（你的大部分信息根本没盖住，都知道是什么字体，一个字符漏俩像素出来就匹配个差不多。涂这半天看着都累还没什么用。。。用黑方块多好？以及说实话你就7个原子，都是“一般元素”，个人着实不认为有任何保密的必要）
作者Author: 让你变成回忆 时间: 2018-7-18 08:28
N系列orS系列的工作，得保密~~
作者Author: 风飞 时间: 2018-7-18 21:39
本帖最后由 风飞 于 2018-7-18 21:40 编辑
我不是一个伸手党，我的4核笔记本正在进行计算，以经开了两个高斯了（我长时间没不在身边，想多利用时间，），再算一个，我感觉我的电脑会卡死了，我正好在看高斯，想到了多步计算，于是就问了，由于特殊原因，我一天白天基本不能做计算，只能晚上回来看看，至于关键词guess=read,Geom=Check和我在高斯手册中搜索过，说实话，我觉得看的不是很明白，但是接触了一段时间的计算化学，我猜想是第个是是读取波函数的初始猜测，第二个是读取check文件中结构，但是想确认一下，刚回来，我计算一下，
我刚刚试了一下，输入文件如下，发现不能进行多任务计算，只有opt。chk文件，没有freq的chk文件。也就是发现只进行了第一个计算
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，
请问可能的原因是？
作者Author: liyuanhe211 时间: 2018-7-18 21:56
1.
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2. （这与你不能进行多步任务无关，但现在的输入真启动了多步任务会报错）上贴说了，--link1--等价于先后运行两个文件。你运行你的link1之后的命令时是一个新的chk文件，显然这样没有任何信息可以联系到你前一步的结果。
P.S. 与其说是条件问题，不如说是态度问题。见得多了。
作者Author: 风飞 时间: 2018-7-19 06:19
那您的意思是说，我这样的写法，高斯不能算完一个任务后，自动的切换到下一个任务
我在百度上搜索到如下写法，发现加上去以后还是不能让高斯算完上一个任务后，自动切换到下一个任务
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怎样写才能让高斯算完一个任务后自动切换到下一个任务呢？
您说--link1-不能实现任务的自动切换到下一个任务，那高斯手册中的多步任务，是怎么回事呢？
再次感谢！
作者Author: sobereva 时间: 2018-7-19 09:55
参考北京科音中级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/KBQC）幻灯片：
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PS：看里面对百度的评价
谈谈学量子化学如何正确地入门
http://sobereva.com/355
作者Author: dreamyeye 时间: 2018-7-19 10:30
本帖最后由 dreamyeye 于 2018-7-19 10:39 编辑
您Link前面写了两条横线，为什么后面还只是一条横线呢？无论是您搜到的网上的例子还是帖子中其他人给您的例子（5楼1.后面的大图显示得很清楚）都是两条横线，您就是复制过去，也是两条横线，可您只有一条。
P.S. 把优化过渡态和算IRC放在一起计算没有必要，如果过渡态优化错了，那IRC也没有必要算了。而且算两个任务，指形成一个输出文件，找第一个任务的输出信息，有时候还不方便。如果第一个任务出错，第二个也不会继续算了。不如用批处理。
作者Author: Shine剪水 时间: 2018-7-19 15:52
本帖最后由 Shine剪水 于 2018-7-19 15:53 编辑
N or S 的话应该找专业的理论与计算化学课题组合作 随便算算有些对自己论文结论不负责吧 建议找合作来负责计算部分的内容
作者Author: 风飞 时间: 2018-7-19 20:08
本帖最后由 风飞 于 2018-7-19 20:10 编辑
嗯，好的，谢谢，横线我是按照手册中的复制过来的，而且在接下来的计算过程中我也尝试改变，结果还是一样的，只计算了第一步
，其实主要原因是我现在经常不在电脑身边，想算完了，就继续算，希望能多利用时间，所以才想着自动算的，我这边算TS之前已经用相对的小基组处理过了，并且也成功跑过了IRC，现在是用大基组进行再次精确，所以想这样做
再次感谢
作者Author: dreamyeye 时间: 2018-7-19 20:15
两条横线应该可以了。
作者Author: 风飞 时间: 2018-7-19 20:30
本帖最后由 风飞 于 2018-7-19 20:32 编辑
老师：您好！已经看完，谢谢老师，说实话我以前刚开始学高斯得时候，是受了百度得毒害，解决502.和999等错误，很多时候都是按照上面加关键词，但是不知道为什么，弄得做计算特别得迷茫和无力感，自从加了您的公社群，进了你得这个论坛，我真得学到了很多东西，谢谢您！但是我也得澄清一下，其实基本上每次问的时候，我基本上都去先去论坛上搜索，是真的没有搜到，我才发帖问的，以前我有固定电脑时，有问题，我还会去搜索群里得聊天记录，但是现在我手里得电脑不是我的，只是暂时用来计算一下，所以也没有去把您的群记录下载下来看（其实我记得您之前在群里也回答过相同得问题）。其实真的感觉这样做了，也许也不会弄得这么狼狈
再次感谢
作者Author: 风飞 时间: 2018-7-19 20:35
本帖最后由 风飞 于 2018-7-19 20:52 编辑
好的，我再试试，谢谢您
我重新算了，发现可以了，但是感觉之前似乎改过这个问题，可能是我用了百度上错误方法改的，结果还是出错了，我现在可以了，突然感觉就跟魔术一样，谢谢！
作者Author: 胡桃木 时间: 2019-6-12 09:44
来自小白的好奇请教，N系列和S系列指啥工作呀。。。
作者Author: sobereva 时间: 2019-6-12 20:07
nature、science
作者Author: 胡桃木 时间: 2019-6-13 10:44
哈哈哈哈哈哈是这个。。。。谢谢sob老师
作者Author: XIEH 时间: 2023-11-20 18:16
您好，想请问一下guess=read和guess=check有什么区别？
作者Author: XIEH 时间: 2023-11-21 09:51
您好，想请问一下guess=read和guess=check有什么区别？
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