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标题: 哪里找得到LAMMPS格式的ReaxFF力场 [打印本页]

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Author: ikea1984 时间: 2018-7-25 22:31
标题: 哪里找得到LAMMPS格式的ReaxFF力场
ADF/ReaxFF用起来太麻烦了，但是其他程序自带的ReaxFF参数都很少。。。

作者
Author: winterzen 时间: 2018-7-26 03:21
1. LAMMPS源码包中的potentials目录里
2. 力场开发论文附带的supporting information文件里
3. 一些力场数据库，如JARVIS-FF (https://mgi.nist.gov/jarvis-ff)

作者
Author: fhh2626 时间: 2018-7-26 06:35
…话说，adf里面自带的力场文件lammps就可以直接用啊…

作者
Author: Mikasa 时间: 2018-7-26 07:04
力场开发的原始文献一般都有力场文件，做Reaxff力场开发的绝大多数都支持LAMMPS

作者
Author: ruanyang 时间: 2018-7-26 20:18

fhh2626 发表于 2018-7-26 06:35
…话说，adf里面自带的力场文件lammps就可以直接用啊…

一般都是通过ADF的ReaxFF列表来寻找力场参数的，感觉很好用

作者
Author: ikea1984 时间: 2018-7-26 23:31

fhh2626 发表于 2018-7-26 06:35
…话说，adf里面自带的力场文件lammps就可以直接用啊…

能直接用？这个操作666啊，我先学学

作者
Author: SAI 时间: 2018-10-27 13:22
请问各位，使用lammps进行ReaxFF计算的后处理一般如何做，例如统计各粒子数等？

作者
Author: 我是一个小白啊 时间: 2019-9-11 10:20

SAI 发表于 2018-10-27 13:22
请问各位，使用lammps进行ReaxFF计算的后处理一般如何做，例如统计各粒子数等？

同问，能不能看到产物中都有何种分子？

作者
Author: tjuptz 时间: 2019-9-11 11:57
https://www.scm.com/doc/ReaxFF/Included_Forcefields.html

作者
Author: sobereva 时间: 2019-9-12 11:13

我是一个小白啊发表于 2019-9-11 10:20
同问，能不能看到产物中都有何种分子？

https://sourceforge.net/projects/chemtrayzer/

作者
Author: yacare 时间: 2019-11-26 19:38
顺便问一下前辈们，ADF是不是只能通过付费方式使用啊？

作者
Author: sobereva 时间: 2019-11-26 23:43

yacare 发表于 2019-11-26 19:38
顺便问一下前辈们，ADF是不是只能通过付费方式使用啊？

显然，还卖得贼黑

作者
Author: 413 时间: 2019-11-27 00:04
本帖最后由 413 于 2019-11-27 00:16 编辑

所有的reaxff参数都一个格式，因为目前市面上所有算reaxff的cpu程序都是从van duin那个stand alone的程序来的，顶多lammps中换了个语言写

作者
Author: yacare 时间: 2019-11-28 09:39

sobereva 发表于 2019-11-26 23:43
显然，还卖得贼黑

那不晓得您处理反应产物都是怎么搞的啊？我看那个species.out文件不靠谱啊。。。
ps：我用的穷哔lammps...

作者
Author: sobereva 时间: 2019-11-29 08:33

yacare 发表于 2019-11-28 09:39
那不晓得您处理反应产物都是怎么搞的啊？我看那个species.out文件不靠谱啊。。。
ps：我用的穷哔lammps. ...

https://sourceforge.net/projects/chemtrayzer/

作者
Author: yacare 时间: 2020-7-21 10:43

sobereva 发表于 2019-11-29 08:33
https://sourceforge.net/projects/chemtrayzer/

社长，还想请教一下，我在运行你推荐的ChemTraYzer的时候，processing.py需要import openbabel，但是我反反复复装了好几回openbabel都只能找到“babel”，而找不到“openbabel”，不知道这种情况你遇到过没，该怎么解决啊，麻烦了~

作者
Author: chema 时间: 2020-7-21 11:18

yacare 发表于 2020-7-21 10:43
社长，还想请教一下，我在运行你推荐的ChemTraYzer的时候，processing.py需要import openbabel，但是我反 ...

之前整过，centos的是
yun install python-openbebal

作者
Author: yacare 时间: 2020-7-21 15:03

chema 发表于 2020-7-21 11:18
之前整过，centos的是
yun install python-openbebal

感谢帮助！我们的服务器是离线的，不能连接网络，该怎么弄呢。。

作者
Author: chema 时间: 2020-7-21 15:13

yacare 发表于 2020-7-21 15:03
感谢帮助！我们的服务器是离线的，不能连接网络，该怎么弄呢。。

那只能看看@大佬有啥法了

作者
Author: yacare 时间: 2020-7-21 15:18

chema 发表于 2020-7-21 15:13
那只能看看@大佬有啥法了

好吧，不管怎样，还是感谢啦！

作者
Author: sobereva 时间: 2020-7-21 22:06
后处理分析也不费多长时间，自己机子上装个vmware虚拟机，在里面的linux系统跑ChemTraYzer就完了，装什么都方便

作者
Author: yacare 时间: 2020-7-21 22:52

chema 发表于 2020-7-21 11:18
之前整过，centos的是
yun install python-openbebal

兄弟，我想确认一下哈，这条命令里面是yun还是yum？如果是yum的话，哪个源上有呢？

作者
Author: zxs1127 时间: 2020-8-21 08:27

sobereva 发表于 2020-7-21 22:06
后处理分析也不费多长时间，自己机子上装个vmware虚拟机，在里面的linux系统跑ChemTraYzer就完了，装什么都 ...

请问管理员，这个处理分析软件有没有教程，本身小白，用着有点费劲，谢谢大佬！

作者
Author: ecustwei 时间: 2023-2-26 16:39

ruanyang 发表于 2018-7-26 20:18
一般都是通过ADF的ReaxFF列表来寻找力场参数的，感觉很好用

请问哪里能搞到ADF带的力场，得先买吗

作者
Author: MineralMD 时间: 2025-8-25 15:23
请问您那边还有ADF的reaxff的力场文件吗

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