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标题: 在服务器上安装高斯出问题 [打印本页]

作者
Author: lastzealot 时间: 2015-5-6 19:23
标题: 在服务器上安装高斯出问题
我把一个g09forlinux.rar文件解压后，通过ftp传到了服务器上。然后开始安装，遇到问题：

1. 首先进入/g09/bsd执行install，成功安装
2. 用vi .bashrc进入，然后修改bashrc文件，修改后其内容为
# .bashrc

# Source global definitions
if [ -f /etc/bashrc ]; then
. /etc/bashrc
fi

# User specific aliases and functions
export GAUSS_EXEDIR=/db/home/haha/g09/
export G09ROOT=/db/home/haha/g09/
export GAUSS_SCRDIR=/db/home/haha/g09/tmp/
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/$G09ROOT
export PATH=/db/home/haha/g09/:$PATH
3. 在g09文件夹中新建scratch和tmp文件夹
4. 执行bashrc文件 source ~/.bashrc，结果每次都出现 -bash: /db/home/haha/g09/gau-machine: Permission denied 错误

请问这到底是怎么回事？
谢谢大家。

作者
Author: 2338225295 时间: 2015-5-7 05:06
1、假定你说的不是源代码编译，因为我估计你没有源代码
2、假定你的~/.bashrc内容是完全的，其实可能你遗漏或隐藏了某段代码
3、假定2成立的话，则你除了修改~/.bashrc以外，肯定还执行了其他操作。比如大胆修改了/etc/bashrc，或者在/etc/profile.d/目录下新增了类似于g09.sh之类的配置文件，否则根本不会出现对gau-machine的调用，除非假定1错误，你是真有源代码试图自己编译
4、假定你获得的rar最初是在linux下压缩的（可能性不大，linux默认不支持rar，需要另行安装），而你先在windows下解压了，再上传到linux上的。
以上假定成立的话，显然你错在不该在windows下解压导致文件属性丢失。
如果最初rar就是在windows下压缩获得的，则更是错误，根本就不应该这样做。
其实在linux下压缩用rar就不是很好的选择，更何况win/linux混用。。直接tar个tgz来多好。。。如果你还能获取在linux下的gaussian，重新做成tgz吧。

作者
Author: sobereva 时间: 2015-5-7 05:52
向linux机子传一堆文件时不要用.rar，个人建议压缩成.zip（winrar就支持），在Linux下直接就能解zip包。

如果你要安装的是已经编译好的版本，不要做第一步
G09ROOT必须写成小写，而且应当指向/db/home/haha
不要自己去这么设LD_LIBRARY_PATH、PATH

简单来说，这么设就行了：

解压到/sob下
建立/sob/g09/scratch
在/root/.bashrc里加入
export g09root=/sob
export GAUSS_SCRDIR=/sob/g09/scratch
source /sob/g09/bsd/g09.profile
在g09/Default.Route里面设定默认参数，如
-M- 3000MB
-P- 4

如果运行时提示
files in the gaussian directory are world accessible. this must be fixed
则在Gaussian目录下运行chmod 750 -R *

作者
Author: lastzealot 时间: 2015-5-7 23:20

sobereva 发表于 2015-5-7 05:52
向linux机子传一堆文件时不要用.rar，个人建议压缩成.zip（winrar就支持），在Linux下直接就能解zip包。

...

感谢大神

作者
Author: 江占 时间: 2015-12-25 18:30

sobereva 发表于 2015-5-7 05:52
向linux机子传一堆文件时不要用.rar，个人建议压缩成.zip（winrar就支持），在Linux下直接就能解zip包。

...

你好
我老板购买了一台电脑 Linux系统的如果直接安装的高斯的话该怎么安装我看了网上的教程设置了不行啊

作者
Author: sobereva 时间: 2015-12-26 07:22

江占发表于 2015-12-25 18:30
你好
我老板购买了一台电脑 Linux系统的如果直接安装的高斯的话该怎么安装我看了网上的教程 ...

3L的做法肯定没问题，没弄好的话是缺乏Linux基础知识

作者
Author: 江占 时间: 2015-12-26 13:36

sobereva 发表于 2015-12-26 07:22
3L的做法肯定没问题，没弄好的话是缺乏Linux基础知识

谢谢我去试试

作者
Author: molu851 时间: 2021-8-19 13:39
有可能是上传文件的时候处于root用户，所以导致文件是root用户下的，后面普通用户登录，会遇到这种被拒绝的提示，需要修改文件的组和用户，再更新一下环境变量即可。

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