计算化学公社

标题: 关于主客体复合物形成过程的热化学参数估算 [打印本页]

作者
Author: luoj17 时间: 2018-8-16 11:26
标题: 关于主客体复合物形成过程的热化学参数估算
请教一个问题。
关于计算主体分子与客体分子通过弱相互作用形成复合物过程的热化学参数。主体分子式C40H24N12O12，含芳香基元，分子量900左右，电中性。客体分子式C3H3O4，分子量100左右，带一个负电荷。客体以Guest表示，两种主体以Host1，Host2表示，复合物的结构优化初始结构来源于晶体结构，优化前后没有太大变化，计算方法及结果如图所示。选择的方法是否合适呢，涉及到的热力学参数计算有没有问题，这样的数据有没有可信度。PS：可能会有些低级错误，请不要生气。谢谢。

作者
Author: sobereva 时间: 2018-8-16 12:05
计算级别不算理想
用B3LYP-D3(BJ)/6-311+G(2d,p) with counterpoise //B3LYP-D3(BJ)/6-311G*明显更恰当。没事别给氢加弥散，白费功夫，这里强调了
谈谈弥散函数和“月份”基组
http://sobereva.com/119

基组的G要大写

计算复合物能量时若不用counterpoise修正BSSE问题容易被审稿人吐槽
谈谈BSSE校正与Gaussian对它的处理
http://sobereva.com/46

作者
Author: luoj17 时间: 2018-8-16 12:35

sobereva 发表于 2018-8-16 12:05
计算级别不算理想
用B3LYP-D3(BJ)/6-311+G(2d,p) with counterpoise //B3LYP-D3(BJ)/6-311G*明显更恰当。 ...

谢谢sob老师，我会把基组换换。我太粗心了，大小写问题我以后一定注意。BSSE问题我参考您的博文已经用了Counterpoise进行了矫正。

作者
Author: 小范范1989 时间: 2018-8-16 16:33
楼主好，能否告知一下，你提到的这个文献呢？谢谢。

作者
Author: luoj17 时间: 2018-8-16 18:00

小范范1989 发表于 2018-8-16 16:33
楼主好，能否告知一下，你提到的这个文献呢？谢谢。

楼上Sob老师给了链接哈。

作者
Author: 小范范1989 时间: 2018-8-16 19:43

luoj17 发表于 2018-8-16 18:00
楼上Sob老师给了链接哈。

楼主好，我表述的不清楚。我的意思是你提到的这个“复合物的结构优化初始结构来源于晶体结构，”
不知道这个文献是哪一个，谢谢。

作者
Author: luoj17 时间: 2018-8-16 19:55

小范范1989 发表于 2018-8-16 19:43
楼主好，我表述的不清楚。我的意思是你提到的这个“复合物的结构优化初始结构来源于晶体结构，”
不知道 ...

你好。相关数据处于还未发表状态，您需要计算文件的话可以发给您，您能帮忙看看的话非常感谢。

作者
Author: 小范范1989 时间: 2018-8-16 19:58

luoj17 发表于 2018-8-16 19:55
你好。相关数据处于还未发表状态，您需要计算文件的话可以发给您，您能帮忙看看的话非常感谢。

偶，这样子，抱歉。
计算的话，我也是会一点点，多交流，方便的话，可以给我学习一下。thanks

作者
Author: luoj17 时间: 2018-8-16 20:10

小范范1989 发表于 2018-8-16 19:58
偶，这样子，抱歉。
计算的话，我也是会一点点，多交流，方便的话，可以给我学习一下。thanks

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)