计算化学公社

标题: 在有原子固定的情况下计算频率出现虚频 [打印本页]

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lastzealot    时间: 2015-5-7 23:22
标题: 在有原子固定的情况下计算频率出现虚频
基底原子固定的条件下,优化结构计算频率后出现一个虚频。如果按照网上说的调整坐标,那么基底原子的坐标也跟着发生变化,与原意不符合。
请问大神有没有什么好办法在不改变基底原子坐标的情况下消除虚频?
谢谢。

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sobereva    时间: 2015-5-8 02:26
如果你的虚频对应的振动模式涉及到基底原子,那么从原理上就不可能又保持基底原子固定又消掉虚频,
作者
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lastzealot    时间: 2015-5-9 00:56
谢谢大神。我的虚频对应的振动不包括基底原子,请问如何解决?
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sobereva    时间: 2015-5-9 05:54
取最后结构先用opt=tight int=ultrafine继续优化,如果还有虚频,用opt=calcfc,如果还不行,用opt=calcall,肯定能解决。
作者
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lastzealot    时间: 2015-5-9 09:06
sobereva 发表于 2015-5-9 05:54
取最后结构先用opt=tight int=ultrafine继续优化,如果还有虚频,用opt=calcfc,如果还不行,用opt=calcall ...

非常感谢大神。这个办法头一次听说,我试试。
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好好学习    时间: 2017-5-19 17:40
sobereva 发表于 2015-5-8 02:26
如果你的虚频对应的振动模式涉及到基底原子,那么从原理上就不可能又保持基底原子固定又消掉虚频,

老师 我冻结原子后 就在冻结的原子那出现了两个虚频 请问这种情况该如何解决呢
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sobereva    时间: 2017-5-19 17:50
好好学习 发表于 2017-5-19 17:40
老师 我冻结原子后 就在冻结的原子那出现了两个虚频 请问这种情况该如何解决呢

没法解决,这本来就是必然会存在的。
如果虚频牵扯的不是你感兴趣的原子区域可以姑且忽略
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好好学习    时间: 2017-5-22 10:36
sobereva 发表于 2017-5-19 17:50
没法解决,这本来就是必然会存在的。
如果虚频牵扯的不是你感兴趣的原子区域可以姑且忽略

谢谢老师
作者
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菜呵呵    时间: 2025-7-10 10:17
sobereva 发表于 2017-5-19 17:50
没法解决,这本来就是必然会存在的。
如果虚频牵扯的不是你感兴趣的原子区域可以姑且忽略

我想请问一下sob老师,那在这种情况下如果想做自由能校正的话应该如何处理呢,还是说在固定原子处出现小虚频就无法进行自由能校正呢?
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wzkchem5    时间: 2025-7-10 13:11
菜呵呵 发表于 2025-7-10 10:17
我想请问一下sob老师,那在这种情况下如果想做自由能校正的话应该如何处理呢,还是说在固定原子处出现小 ...

算完Hessian以后,把基底原子的贡献投影掉,再计算频率、热化学校正等。但不是所有程序都支持这么做
作者
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菜呵呵    时间: 2025-7-10 13:44
wzkchem5 发表于 2025-7-10 13:11
算完Hessian以后,把基底原子的贡献投影掉,再计算频率、热化学校正等。但不是所有程序都支持这么做

谢谢您的解答,但是我还有一点疑问,投影掉基底原子的贡献是指不考虑其对热力学校正的贡献,是这个意思么,还有如果是在Gaussian中如何进行这一操作呢




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