计算化学公社

标题: 用DALTON计算出来的双光子吸收截面很小，原因是什么呢？ [打印本页]

作者
Author: Yin 时间: 2018-8-29 10:18
标题: 用DALTON计算出来的双光子吸收截面很小，原因是什么呢？
本帖最后由 Yin 于 2018-8-29 10:18 编辑

以下是我的dal文件
我用了B3LYP，CAMB3LYP，B1LYP，BHandHLYP泛函进行尝试，计算出来的双光子吸收截面值都很小。实验室是112GM，我用这些泛函计算出来最大的也只有23GM，波长也不匹配。请问大家，我的dal文件正确吗？还有什么别的原因，导致我算出来的值很小呢？

作者
Author: 小范范1989 时间: 2018-8-29 11:43
.SOLVNT
TOLUENE
.NPCMMT
0
.NESFP
9
.ICESPH
2
*PCMCAV
.INA
1
2
3
4
5
6
12
13
14
.RIN
2.125
2.125
2.125
1.925
2.125
2.125
1.925
1.750
2.525
.AREATS
0.4
这是当时计算的时候，设置溶剂。

dalton这个溶剂，是不是需要自己定义这些参数什么的？不能简简单单写个solvent。
具体我也不知道，个人见解。

作者
Author: Yin 时间: 2018-8-29 14:50

小范范1989 发表于 2018-8-29 11:43
.SOLVNT
TOLUENE
.NPCMMT

谢谢，我参照你这个试试

作者
Author: 小范范1989 时间: 2018-8-29 17:35

Yin 发表于 2018-8-29 14:50
谢谢，我参照你这个试试

别，咱们溶剂不一样，你参考这个没用。这个需要前期高斯计算。

作者
Author: 柒月小鱼 时间: 2018-8-29 22:09
别的我不懂，溶剂模型的使用好好看看手册就可以了，对于原子数目不是太多，按你现在的输入是没有问题的
要是原子数目太多的话，需要给原子定义一个合适的空腔半径。
PCM模型的输入：在不知道准确值的时候，直接
*PCM
.SOLVNT
METHYLCL
*PCMCAV
.NEQRSP
计算完后在.out文件中搜SPHERES
就可以看到Dalton的自定义空腔半径
我们计算的分子一般比较大，必须自定义空腔半径，否则计算无法继续下去
.INA                   /非H原子的.mol的顺序排列
1                /在.mol文件中的第一个原子
.RIN
1.7                      /第一个原子的自定义半径

作者
Author: Yin 时间: 2018-8-29 22:11

小范范1989 发表于 2018-8-29 17:35
别，咱们溶剂不一样，你参考这个没用。这个需要前期高斯计算。

就是你前面发的这个dal文件的数据是根据你高斯计算出来的数据修改的吗？那这个是你通过用高斯计算什么得来的呢？可以详细说说吗
我也是先用高斯优化后，然后再用dalton计算双光子吸收的

作者
Author: 小范范1989 时间: 2018-8-30 08:55

Yin 发表于 2018-8-29 22:11
就是你前面发的这个dal文件的数据是根据你高斯计算出来的数据修改的吗？那这个是你通过用高斯计算什么得 ...

用g03计算，溶剂中优化分子。
计算完之后，读取文件：united atom topological.........
后面就有了。

作者
Author: Yin 时间: 2018-8-30 09:44

柒月小鱼发表于 2018-8-29 22:09
别的我不懂，溶剂模型的使用好好看看手册就可以了，对于原子数目不是太多，按你现在的输入是没有问题的
要 ...

好的，非常感谢

作者
Author: Yin 时间: 2018-8-30 09:45

小范范1989 发表于 2018-8-30 08:55
用g03计算，溶剂中优化分子。
计算完之后，读取文件：united atom topological.........
后面就有了。

谢谢~

作者
Author: Yin 时间: 2018-10-6 09:21

柒月小鱼发表于 2018-8-29 22:09
别的我不懂，溶剂模型的使用好好看看手册就可以了，对于原子数目不是太多，按你现在的输入是没有问题的
要 ...

你好，我再请教一下。如果是原子数目很多的话，那么要给每个原子（除了H）都定义一个空腔半径吗？

作者
Author: 柒月小鱼 时间: 2018-10-6 12:27

Yin 发表于 2018-10-6 09:21
你好，我再请教一下。如果是原子数目很多的话，那么要给每个原子（除了H）都定义一个空腔半径吗？

是的

作者
Author: Yin 时间: 2018-10-6 15:45

柒月小鱼发表于 2018-10-6 12:27
是的

好的非常感谢

作者
Author: yuiop 时间: 2019-8-29 16:30

柒月小鱼发表于 2018-8-29 22:09
别的我不懂，溶剂模型的使用好好看看手册就可以了，对于原子数目不是太多，按你现在的输入是没有问题的
要 ...

您好！请问一下每个原子的空腔半径应该设为多少才合适啊？有参考文献之类的推荐吗？谢谢！

作者
Author: yuiop 时间: 2019-8-29 16:49

小范范1989 发表于 2018-8-30 08:55
用g03计算，溶剂中优化分子。
计算完之后，读取文件：united atom topological.........
后面就有了。

您好！请问这是从PCM模型优化的log文件中读取的吗？我搜索了整个文件，没有发现united atom topological等信息，请问需要加什么额外的关键词吗？谢谢！

作者
Author: 小范范1989 时间: 2019-8-29 18:39

yuiop 发表于 2019-8-29 16:49
您好！请问这是从PCM模型优化的log文件中读取的吗？我搜索了整个文件，没有发现united atom topological ...

是g03计算，往后的版本不行。

作者
Author: 柒月小鱼 时间: 2019-8-29 18:51

yuiop 发表于 2019-8-29 16:30
您好！请问一下每个原子的空腔半径应该设为多少才合适啊？有参考文献之类的推荐吗？谢谢！

搜一下我发的帖子

作者
Author: yuiop 时间: 2019-8-29 19:28

小范范1989 发表于 2019-8-29 18:39
是g03计算，往后的版本不行。

哦，好的，谢谢您！

作者
Author: yuiop 时间: 2019-8-29 19:32

柒月小鱼发表于 2019-8-29 18:51
搜一下我发的帖子

好的，谢谢您！

作者
Author: weixue 时间: 2022-5-24 16:28

柒月小鱼发表于 2018-8-29 22:09
别的我不懂，溶剂模型的使用好好看看手册就可以了，对于原子数目不是太多，按你现在的输入是没有问题的
要 ...

您好！请问一下，这个原子数目多少的时候需要定义空腔半径呢？我的体系150个原子，按照上面的dal文件也正常结束了

作者
Author: weixue 时间: 2022-5-24 16:28

小范范1989 发表于 2018-8-30 08:55
用g03计算，溶剂中优化分子。
计算完之后，读取文件：united atom topological.........
后面就有了。

您好！请问一下，这个原子数目多少的时候需要定义空腔半径呢？我的体系150个原子，按照上面的dal文件也正常结束了

作者
Author: 小小喜乐 时间: 2026-2-7 22:11
请问，需要加上DIPLEN这个关键词吗

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)