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标题: 用Stuttgart基组选择不同核数赝势计算单点能,差异很大,这是为啥? [打印本页]

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Tanya    时间: 2018-9-2 20:39
标题: 用Stuttgart基组选择不同核数赝势计算单点能,差异很大,这是为啥?
本帖最后由 Tanya 于 2018-9-3 08:30 编辑

本人初学Gaussian中。
先用6-31g*/SDD混合基组,B3LYP方法,对我们实验室常用的化合物“三[双(三甲基硅基)胺基]镧”进行了结构优化,然后再用6-311+g**和5个不同的赝势基组计算结构优化后的单点能,发现差别挺大的,结果在下表中。
  
赝势基组
  
  
Energy (Hartree)
  
  
Dipole oment(Ddbye)
  
ECP28MWB-ANO
  
  
RB3LYP Energy -3056.36540455
  
  
2.0897
  
  
ECP28MWB-SEG
  
  
RB3LYP Energy -3056.36613588
  
  
2.0942
  
  
MWB28
  
  
RB3LYP Energy -3056.36613588
  
  
2.0942
  
  
MWB46
  
  
RB3LYP Energy -2652.27969067
  
  
2.1697
  
  
MWB47
  
  
UB3LYP Energy -2646.64291569
  
  
1.1488
  
注:
1、ECP28MWB-ANO和ECP28MWB-SEG是从网站上下载的赝势基组;
2、MWB28、MWB46和MWB47是Gaussian内置的Stuttgart基组关键词。
3、除La外,其他元素用6-311+g**
4、方法B3LYP,加上了GD3。

从计算结果可以看出,ECP28MWB-SEG和MWB28完全相同,说明内置的La小核y赝势基组MWB28与网站上的ECP28MWB-SEG完全一样,并且与同样是小核的ECP28MWB-ANO结果差别不大。但是MWB28,MWB46,MWB47之间的差别就很大了,我该相信哪个结果呢?


三[双(三甲基硅基)胺基]镧的结构:
file:///C:/Temp/msohtmlclip1/01/clip_image008.png
(, 下载次数 Times of downloads: 71) (, 下载次数 Times of downloads: 86)

以下是计算结果截图:
ECP28MWB-ANO
(, 下载次数 Times of downloads: 60)

ECP28MWB-SEG
(, 下载次数 Times of downloads: 77)

MWB28
(, 下载次数 Times of downloads: 60)

MWB46:
(, 下载次数 Times of downloads: 63)

MWB47
(, 下载次数 Times of downloads: 60)

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sobereva    时间: 2018-9-2 23:50
计算中考虑的内核电子数不同,单点能自然有巨大差异,属于常识

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Accelerator    时间: 2018-9-3 04:14
想知道这些截图是什么可视化软件出来的
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Tanya    时间: 2018-9-3 08:21
sobereva 发表于 2018-9-2 23:50
计算中考虑的内核电子数不同,单点能自然有巨大差异,属于常识

谢谢Sob老师的回答。
还有疑问:
同一个赝势基组,虽然内核电子数不同。但都有研究给出了专门的赝势,不就是为了更准确么,差别这么大也算正常?
分子中一共有98个原子,只有La用了不同的基组,能量就差别就达到15%(MWB46相对MWB28),一般相对误差大约多少算是基本合理呢?
是不是不同的基组之间不能做横向比较?
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Tanya    时间: 2018-9-3 08:23
Accelerator 发表于 2018-9-3 04:14
想知道这些截图是什么可视化软件出来的

用了WebMO的免费版,可以从这里下载:https://www.webmo.net/#opennewwindow

单机使用挺方便的,可以直接用Web方式访问服务器,提交任务,可以在线看任务进行情况。
我的服务器放在学校办公室,通过学校的VPN方式,还可以直接在家里提交任务。

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sobereva    时间: 2018-9-3 20:04
Tanya 发表于 2018-9-3 08:21
谢谢Sob老师的回答。
还有疑问:
同一个赝势基组,虽然内核电子数不同。但都有研究给出了专门的赝势, ...

不同基组间的能量不能横向对比这是量化计算最基本常识之一
赝势下计算的能量只是计算过程中直接考虑的电子的能量,显然大核和小核赝势会因为电子数不同而能量有巨大差异
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Tanya    时间: 2018-9-3 22:36
做过很长时间分析测试工作,即使用不同方法测试,正确结果应该很接近,否则测试方法就有问题。不同方法结果不一样,就有点心慌慌。看来这种思维方式不能带到量化中来。
作者
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sobereva    时间: 2018-9-4 03:00
Tanya 发表于 2018-9-3 22:36
做过很长时间分析测试工作,即使用不同方法测试,正确结果应该很接近,否则测试方法就有问题。不同方法结果 ...

在量化里,绝对能量是没有意义的,只有相对能量才是化学上感兴趣的,比较不同级别计算结果,也都应当比相对能量对应的化学量(诸如势垒、反应能量变化、激发能等)
作者
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Tanya    时间: 2018-9-4 09:59
sobereva 发表于 2018-9-4 03:00
在量化里,绝对能量是没有意义的,只有相对能量才是化学上感兴趣的,比较不同级别计算结果,也都应当比相 ...

嗯,这个是理解的。
这段时间一直在看你的博客和帖子,各种比较。所以想看看自己新买的电脑计算不同的基组花多少时间,也算是个学习过程吧。
作者
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19970306    时间: 2020-5-22 21:46
您好,很抱歉打搅您,请问一下ECP28MWB-ANO和基组库里的ANO-RCC有什么区别吗
作者
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19970306    时间: 2020-5-23 09:21
19970306 发表于 2020-5-22 21:46
您好,很抱歉打搅您,请问一下ECP28MWB-ANO和基组库里的ANO-RCC有什么区别吗

找到了




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