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标题: 怎样比较两种有机分子聚集倾向的大小? [打印本页]

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苏玖染    时间: 2018-9-4 09:37
标题: 怎样比较两种有机分子聚集倾向的大小?
有三种分子,A/B/C,原子数在60~80的有机分子,我各放了18个分子(共54个分子)在水溶液中处于聚集-解聚平衡状态,请问怎样比较其中两种分子的聚集倾向的大小,比如说A和B更容易聚集,或者说C更容易自聚;我尝试了用径向分布函数和空间分布函数去做,但是效果都不是很好,请问有更好的方法么?

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sobereva    时间: 2018-9-4 10:49
注意求助帖应当在帖子标题明确体现出提问、求助(见http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html),给你改了
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sobereva    时间: 2018-9-4 11:38
比如自己写脚本,考察A附近一定距离内B的平均个数,C一定距离内出现C的平均个数
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苏玖染    时间: 2018-9-4 14:43
sobereva 发表于 2018-9-4 11:38
比如自己写脚本,考察A附近一定距离内B的平均个数,C一定距离内出现C的平均个数

好的,谢谢sob老师
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brothers    时间: 2018-9-4 19:41
比如可以算一下不同分子间的相互作用能,如果A-B的相互作用能大于A-A的和AC的,那就说明A-B容易聚集吧。ms的blends模块里评估不同分子相溶性的例子,可以参考看看
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苏玖染    时间: 2018-9-5 15:23
brothers 发表于 2018-9-4 19:41
比如可以算一下不同分子间的相互作用能,如果A-B的相互作用能大于A-A的和AC的,那就说明A-B容易聚集吧。ms ...

好的,谢谢您,我的体系比较大,MS估计做不了




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