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标题: 求助保存VMD环境时遇到的问题 [打印本页]

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qianbao    时间: 2018-9-4 10:31
标题: 求助保存VMD环境时遇到的问题
用VMD观看电荷转移情况时,每次打开都是各种调节很麻烦,所以想按照帖子里面save visualization state。不知道是不是自己理解错误:
1、“在你完全设定好观看等值面的显示方式后,选择Extensions-Visualization-View Master,然后点Create New,再选File-Save as,然后保存为比如ViewMO.tcl,这个文件里就包含了你之前调节显示方式的每一步操作。
我的操作:打开一个cub文件,设定(背景颜色以及等值面等)好后,直接进行Extensions等操作。
2、“下回再想看轨道等值面的时候,只需在VMD里选择File-Load visualization state,然后选择那个.tcl文件,之前的显示方式设定就会完全恢复。
这样确实打开了之前的分子轨道
3、“不过,如果你的cube文件路径和之前的不同,应该用文本编辑器打开那个.tcl文件,将第五行的cube文件路径改为实际的。
这个都是在一个文件下的
4、“另外,如果cube文件内容发生了变化,通过载入.tcl恢复显示方式后,等值面可能并没有在图形窗口中出现,此时稍微调节一下设定即可,比如改一下Isovalue,或者把Step从默认的1改为2,等值面就又出现了,然后再把设定改回去即可。
我的操作:打开第二个cube文件,load visualization state(是载入.tcl的操作吧?)打开刚才保存的环境,就出现了两个这样的。
所以,不知道是否可以直接保存一个环境,让我下次打开另一个 可以不用设定那么多。

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sobereva    时间: 2018-9-4 11:40
用文本编辑器打开visualization state,试图理解里面各个条目的含义,怎么修改能达到期望的效果不言自明
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qianbao    时间: 2018-9-4 14:08
好的,谢谢老师!已清楚!
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18783980657    时间: 2019-2-27 17:30
qianbao 发表于 2018-9-4 14:08
好的,谢谢老师!已清楚!

请问下,保存之后的tcl文件,再次打开后能灵活旋转吗?和Gview一样吗?
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sobereva    时间: 2019-2-27 21:01
18783980657 发表于 2019-2-27 17:30
请问下,保存之后的tcl文件,再次打开后能灵活旋转吗?和Gview一样吗?

可。
保存的不是图片,而是绘制状态,显然还能旋转

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qianbao    时间: 2019-3-18 09:35
18783980657 发表于 2019-2-27 17:30
请问下,保存之后的tcl文件,再次打开后能灵活旋转吗?和Gview一样吗?

按照老师帖子里的打开方式,再打开 就是原来您设置的样式;如果存为模板的话,套入一个新的分子,只需要改一下新分子的位置,也得到相同的设置
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qianbao    时间: 2019-5-10 19:26
18783980657 发表于 2019-2-27 17:30
请问下,保存之后的tcl文件,再次打开后能灵活旋转吗?和Gview一样吗?

可以的,就是一个模板,套上模型后,就能正常操作




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