计算化学公社

标题: Homo与Lumo的密度差分图与电荷密度差分图是一个东西吗? [打印本页]

作者
Author:
DUNING    时间: 2018-9-21 20:34
标题: Homo与Lumo的密度差分图与电荷密度差分图是一个东西吗?
最近看了一篇文章,他们做了Homo与Lumo的密度差分图,我也想试着做一下,但是不知道这是不是我们平时说的电荷密度差分图呢?自我感觉两者好像不是一个意思。

作者
Author:
sobereva    时间: 2018-9-21 20:39
仔细看
使用Multiwfn作电子密度差图
http://sobereva.com/113

绘制HOMO和LUMO对应的密度的密度差并没有什么意义,我很不建议效仿此文的做法

真想要考察HOMO和LUMO的重叠程度,应当用Multiwfn,详见此文
使用Multiwfn考察轨道间重叠程度和质心距离
http://sobereva.com/371

灵活利用Multiwfn也可以实现把HOMO和LUMO有重叠的区域绘制出来,比如以等值面的方式绘制衡量不同区域二者交叠程度的sqrt(|psi_HOMO|*|psi_LUMO|)
作者
Author:
DUNING    时间: 2018-9-21 20:48
sobereva 发表于 2018-9-21 20:39
仔细看
使用Multiwfn作电子密度差图
http://sobereva.com/113

谢谢老师,所以电子密度差分图与HOMO-LUMO重叠程度是不一样的是吗?
作者
Author:
sobereva    时间: 2018-9-21 20:53
DUNING 发表于 2018-9-21 20:48
谢谢老师,所以电子密度差分图与HOMO-LUMO重叠程度是不一样的是吗?

怎么可能一样,完全不同的概念,完全不同的计算方式
作者
Author:
DUNING    时间: 2018-9-21 21:15
sobereva 发表于 2018-9-21 20:53
怎么可能一样,完全不同的概念,完全不同的计算方式

好的,老师,现在我想要绘制这两个轨道的重叠,能否具体说明一下操作呢,本人对Multiwfn的确不熟练,感谢老师的耐心解答
作者
Author:
sobereva    时间: 2018-9-21 21:40
DUNING 发表于 2018-9-21 21:15
好的,老师,现在我想要绘制这两个轨道的重叠,能否具体说明一下操作呢,本人对Multiwfn的确不熟练,感谢 ...

先用Multiwfn分别产生HOMO和LUMO的cube文件,这里提及了
使用Multiwfn观看分子轨道
http://sobereva.com/269

然后用Multiwfn的主功能13中的格点文件运算功能(子功能11)中的操作22,来对这两个cube文件求min(|A|,|B|),即求二者绝对值的最小值,这个函数可以衡量什么地方二者有明显交叠。然后就可以用选项-1来观看新产生的格点数据的等值面了,或者把当前格点数据导出cube文件再用其它程序显示。如果不会用Multiwfn的格点文件运算功能,看Multiwfn手册4.13.2节的例子。
作者
Author:
阿锋001    时间: 2019-12-7 09:39
sobereva 发表于 2018-9-21 20:39
仔细看
使用Multiwfn作电子密度差图
http://sobereva.com/113

社长,我还是想绘制HOMO和LUMO的密度差图,请问如何做呢,烦请指点,谢谢!
作者
Author:
sobereva    时间: 2019-12-8 18:48
阿锋001 发表于 2019-12-7 09:39
社长,我还是想绘制HOMO和LUMO的密度差图,请问如何做呢,烦请指点,谢谢!

在Multiwfn里用主功能6的子功能26把HOMO轨道以外的轨道占据数清零,然后照常产生电子密度cube文件(把手册4.5节的例子都做一遍自然就会了),即得到HOMO的密度的cube文件。类似地也产生LUMO的密度的cube文件(LUMO占据数设成和原本的HOMO相同,其它轨道占据数都设0)。之后用主功能13对格点数据求差就完了(把Multiwfn手册4.13节的例子仔细看过一遍,举一反三自然就会了)




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3