计算化学公社

标题: 基于PDF分析得出的结构计算UV的问题 [打印本页]

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作者
Author: 薛定谔的老猫    时间: 2018-9-24 09:41
标题: 基于PDF分析得出的结构计算UV的问题
各位老师好，最近我们实验室通过PDF数据分析模拟的方式得出了一个结构，然后基于这一个结构，我需要计算其不同环境下的UV，以及考虑连接配体和不连配体之间UV的差别，通过查阅文献和论坛里的资料拟用PBE0,M062X，wB97XD计算其UV，但现仍存以下疑惑，还望给予建议:(1)基于这一PDF得出的结构，在不考虑连接配体时是否一定需要对这一结构进行基态优化？因为如果优化该结构，那么PDF的结构就会破坏。（2）我计算的体系主要是包含60个第4,5周的原子，采用如上方法大概需要多长时间，没啥经验，想了解一下。（3）如果加上配体，原子数就有200左右，还可以用Gaussian计算呢？非常感谢。

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作者
Author: 雨夕子    时间: 2018-9-24 09:59


1）晶体结构提取获得的结构用于计算时，有时可以不做进一步优化的。也可以选择只对处理过的部分（比如边界、配体等进行限制性部分优化）。具体当然要视情况而定。
2）计算时间与使用的研究方法（GGA、双杂化、MPn等）和基组、体系的大小、具体任务（opt、freq、TD-DFT）以及机器性能有关系。这里信息不足，无法给出。
3）200+原子的UV计算还是比较耗时的。

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作者
Author: 薛定谔的老猫    时间: 2018-9-25 08:04

雨夕子 发表于 2018-9-24 09:59
1）晶体结构提取获得的结构用于计算时，有时可以不做进一步优化的。也可以选择只对处理过的部分（比如边界 ...

好的，非常感谢，基组对于轻元素采用def-TZVP,重元素LANL2DZ，主要就是Cd, Zn, S, Se. 想裸核算一次（TDDFT)，加上配体算一次(TDDFT)，不加配体60个原子左右，大概需要多长时间呢，需要的时间太久的话，方案确定了还是和老板商量用超算吧。

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