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标题: multiwfn与vmd进行弱相互作用分析，如何一次性载入两个分子？ [打印本页]

作者
Author: 涅涅尘 时间: 2018-10-9 15:38
标题: multiwfn与vmd进行弱相互作用分析，如何一次性载入两个分子？
求助
在使用multiwfn和vmd对分子体系进行弱相互作用分析的时候，如何在vmd中一次性载入两个或者多个体系，每次只能做一个，有点麻烦（尤其是想对比的时候）。
目前是在multiwfn中操作导出"fuc1.cub、fuc2.cub"两个文件，然后再在vmd中载入以下脚本便可以进行弱相互作用分析

mol new func1.cub
mol addfile func2.cub
mol delrep 0 top
mol representation CPK 1.0 0.3 18.0 16.0
mol addrep top
mol representation Isosurface 0.50000 1 0 0 1 1
mol color Volume 0
mol addrep top
mol scaleminmax top 1 -0.04 0.02
color scale method BGR
color Display Background white
axes location off

复制代码

但是如果想要一次性做两个分子体系怎么办？我目前是这么做的，把另一个分子导出的.cub文件重命名为"fuc3.cub、fuc4.cub"，然后再按照以下代码重建一个.vmd文件，然后vmd载入一个体系后，再载入这个体系。

mol new func3.cub
mol addfile func4.cub
mol delrep 0 top
mol representation CPK 1.0 0.3 18.0 16.0
mol addrep top
mol representation Isosurface 0.50000 1 0 0 1 1
mol color Volume 0
mol addrep top
mol scaleminmax top 1 -0.04 0.02
color scale method BGR
color Display Background white
axes location off

复制代码

但是结果是在vmd的分子窗口中两个体系一起出现了，我只能通过在"VMD main"窗口中点击"D"来让某个分子显示或者不现实，
那么，有没有办法让两个分子各占据一个窗口，分离开他们呢，这样也方便进行比较。
求指教。

作者
Author: sobereva 时间: 2018-10-9 18:25
VMD只能有一个图形窗口，显示两个图形窗口你得启动两个VMD

作者
Author: 涅涅尘 时间: 2018-10-9 18:58

sobereva 发表于 2018-10-9 18:25
VMD只能有一个图形窗口，显示两个图形窗口你得启动两个VMD

谢谢
看来我这个方法还是比较可行的

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