计算化学公社

标题: PbS团簇应该怎么建模？通过genmer可以吗？ [打印本页]

作者
Author: didida 时间: 2018-10-15 19:03
标题: PbS团簇应该怎么建模？通过genmer可以吗？
(, 下载次数 Times of downloads: 63) 请问，这种团簇应该怎么建模？通过genmer可以吗？

作者
Author: 我本是个娃娃 时间: 2018-10-15 22:09
有那么难吗？
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作者
Author: 卡开发发 时间: 2018-10-15 22:53
本帖最后由卡开发发于 2018-10-16 06:50 编辑

自己造可以这样造：
1、拿MS或者别的导入一个NaCl格子
2、Na->Pb，Cl->S
3、（QD1）取消周期性边界；（QD2）建立3x3x3超晶格，8个角每个各截去4个原子，取消周期性边界；（QD3）建立3x3x3超晶格，8个角各截去1个原子，取消周期性边界。

作者
Author: coolrainbow 时间: 2018-10-15 23:09
ABCluster也可以很容易的做这个工作。不过它找的是全局极小点，显然不会是这中八个角都有凹面的结构。只有一个棱
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作者
Author: sobereva 时间: 2018-10-16 01:05
你先找来PbS的晶体结构文件，然后用gview或M$之类延展成较大的复晶胞，保存成结构文件载入到VMD里，然后按照http://bbs.keinsci.com/thread-11104-1-1.html的3L的做法抠出特定半径的球形即可。如果边边角角有不太合适的地方可以在gview里进一步修剪。

注意求助帖应当在帖子标题明确体现出提问、求助（见http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html），给你改了，望以后注意

作者
Author: didida 时间: 2018-10-16 08:29

我本是个娃娃发表于 2018-10-15 22:09
有那么难吗？

谢谢您，刚刚起步学习。

作者
Author: didida 时间: 2018-10-16 08:29

卡开发发发表于 2018-10-15 22:53
自己造可以这样造：
1、拿MS或者别的导入一个NaCl格子
2、Na->Pb，Cl->S

非常感谢

作者
Author: didida 时间: 2018-10-16 08:30

coolrainbow 发表于 2018-10-15 23:09
ABCluster也可以很容易的做这个工作。不过它找的是全局极小点，显然不会是这中八个角都有凹面的结构。只有 ...

谢谢

作者
Author: didida 时间: 2018-10-16 08:30

sobereva 发表于 2018-10-16 01:05
你先找来PbS的晶体结构文件，然后用gview或M$之类延展成较大的复晶胞，保存成结构文件载入到VMD里，然后按 ...

好的，老师，我下次注意，非常感谢老师的回答。

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