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标题: 优化完分子的结构变形特别大,可能是什么原因,该怎样解决呢? [打印本页]

作者
Author:
CocuLiu    时间: 2018-10-18 15:31
标题: 优化完分子的结构变形特别大,可能是什么原因,该怎样解决呢?
MS中 Dmol3模块计算两个分子。
第一步构建一个空的立方体晶体盒子(65*65*65),放两个分子放进去后(放在盒子中间),进行优化任务(GGA-PBE,DNP,,,,use DFT-D, use spin unrestricted , use Multiplicity=Doublet,  use symmetry,  use DIIS,,   Quality均为fine),,,在这样的设置下,优化完分子的结构变形特别大。导致无法利用优化完的结构  跑Dynamics。
请问老师这有可能是什么原因,该怎样解决呢?

作者
Author:
sobereva    时间: 2018-10-18 18:20
算分子体系设盒子启用周期性纯粹多此一举自找麻烦

http://bbs.keinsci.com/thread-10554-1-1.html
作者
Author:
CocuLiu    时间: 2018-10-18 20:20
谢谢您,老师。




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