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标题: 隐式溶剂模型,如果蛋白质的静电菏不为零,对于Gromacs应当怎么处理呢? [打印本页]

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harrypotty18    时间: 2018-10-21 00:40
标题: 隐式溶剂模型,如果蛋白质的静电菏不为零,对于Gromacs应当怎么处理呢?
请教下各路大神:对于隐式溶剂模型,如果蛋白质的静电菏不为零,对于Gromacs应当怎么处理呢?相应的mdp应当是怎么样呢?

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sobereva    时间: 2018-10-21 05:23
注意求助帖应当在帖子标题明确体现出提问、求助(见http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html),给你改了,望以后注意

对于使用隐式溶剂模型的情况,蛋白净电荷不为零没关系,也不需要加抗衡离子,也不需要额外的设置
作者
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harrypotty18    时间: 2018-10-21 10:35
sobereva 发表于 2018-10-21 05:23
注意求助帖应当在帖子标题明确体现出提问、求助(见http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html),给你 ...

谢谢@Sob解答,我以后注意,非常感谢




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