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标题: 常见热力学组合方法精度、耗时的关系 [打印本页]

作者
Author: sobereva 时间: 2015-5-18 15:28
标题: 常见热力学组合方法精度、耗时的关系
热力学组合方法在高精度计算小体系热化学数据时很常用。原理就不提了，北京科音初级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KEQC_content.html）会简要讲，到北京科音中级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KBQC_content.html）会深入讲。这里只是把不同热力学组合方法的精度关系、耗时关系进行简单的列举，对于实际应用中的方法选择相信有好处。
由于CBS-APNO只有一、二周期的参数，没法计算含氯的，所以唯独其计算例子改成了三氟乙烯。

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G4(MP2)-6X当时没有纳入测试，但很值得使用，见：
高性价比热力学组合方法G4(MP2)-6X的计算方法
http://sobereva.com/419

作者
Author: XZDZ 时间: 2017-10-21 15:04
哦~好的。谢谢老师

作者
Author: Shine剪水 时间: 2019-5-8 16:44
社长，CBS-4M适用于大概多大的体系呀，100左右原子的分子20核的服务器能算动吗

作者
Author: sobereva 时间: 2019-5-8 19:30

Shine剪水发表于 2019-5-8 16:44
社长，CBS-4M适用于大概多大的体系呀，100左右原子的分子20核的服务器能算动吗

CBS-4M过时了，建议不要再用

作者
Author: granvia 时间: 2019-5-8 20:24
有个疑问：高斯热力学计算所引入的近似，如理想气体，各种运动模式是彼此不耦合的（即总配分函数是乘积形式），振动是简谐的，不考虑电子激发（如单重态和三重态能差较小可能误差较大），那么当这些近似引起主要误差时，上述计算方法对误差的改进是否就没多大意义了呢？

作者
Author: Shine剪水 时间: 2019-5-8 21:19

sobereva 发表于 2019-5-8 19:30
CBS-4M过时了，建议不要再用

那想要误差在2~3Kcal/mol的计算方法基组应该怎么选择啊社长

作者
Author: sobereva 时间: 2019-5-9 08:38

Shine剪水发表于 2019-5-8 21:19
那想要误差在2~3Kcal/mol的计算方法基组应该怎么选择啊社长

常规方法计算，高精度单点+便宜级别算的热力学校正量

作者
Author: sobereva 时间: 2019-5-9 08:40

granvia 发表于 2019-5-8 20:24
有个疑问：高斯热力学计算所引入的近似，如理想气体，各种运动模式是彼此不耦合的（即总配分函数是乘积形式 ...

那些近似，对于理论研究大量化学问题是充分适用的。如果实际情况有哪条严重不适合当前的近似，近似会造成显著误差，需要手动修正（比如电子激发的贡献），或者用额外方式考虑（非谐振、受阻转子等），或者利用其它程序（如第一性原理一类的考虑凝聚相情况）。

作者
Author: Jaydu1996 时间: 2019-8-24 09:36
老师您好，热力学组合原理有没有相关的帖子推荐可以了解一下，网上搜的都比较零碎，

作者
Author: sobereva 时间: 2019-8-25 00:37

Jaydu1996 发表于 2019-8-24 09:36
老师您好，热力学组合原理有没有相关的帖子推荐可以了解一下，网上搜的都比较零碎，

看原文

作者
Author: niobium 时间: 2019-8-25 09:12

Jaydu1996 发表于 2019-8-24 09:36
老师您好，热力学组合原理有没有相关的帖子推荐可以了解一下，网上搜的都比较零碎，

https://mp.weixin.qq.com/s?__biz ... 3&lang=zh_CN#rd

作者
Author: sobereva 时间: 2019-8-26 02:58
(, 下载次数 Times of downloads: 155)
(, 下载次数 Times of downloads: 131)
(, 下载次数 Times of downloads: 126)

更多知识除了看原文外可以看以下综述
DOI: 10.1002/wcms.59
doi: 10.1002/wcms.1249
DOI 10.1007/978-3-319-27282-5_13

作者
Author: Jaydu1996 时间: 2019-8-26 21:50

sobereva 发表于 2019-8-26 02:58
更多知识除了看原文外可以看以下综述
DOI: 10.1002/wcms.59
doi: 10.1002/wcms.1249

谢谢老师，

作者
Author: linima 时间: 2019-11-28 16:58

sobereva 发表于 2019-8-26 02:58
更多知识除了看原文外可以看以下综述
DOI: 10.1002/wcms.59
doi: 10.1002/wcms.1249

sob老师，我之前用G4的方法是直接在输入文件里写的G4，不知道这里面说的这个G4跟我用的这个G4有什么区别吗？(这种问题是基础问题应该在另外一个专门的帖子里问的，但恰好在这里看到了就在这下面问了

）

作者
Author: sobereva 时间: 2019-11-29 08:29

linima 发表于 2019-11-28 16:58
sob老师，我之前用G4的方法是直接在输入文件里写的G4，不知道这里面说的这个G4跟我用的这个G4有什么区别 ...

就是同一个

作者
Author: 雨做的云 时间: 2020-6-10 10:21

sobereva 发表于 2019-5-9 08:38
常规方法计算，高精度单点+便宜级别算的热力学校正量

老师，我想问下对于一个有12个重原子，大概27个原子的结构来说，用M062x/6-311++g(d,p)来做几何优化，用CBS-QB3只计算单点可以吗？这样切换泛函对吗？

作者
Author: yflchx 时间: 2020-6-10 10:44
补一篇新发表的文章，里面有些测试比较，另外作者还提出了DLPNO-CCSD(T)取代CCSD(T)，意义不言而喻。

Emmanouil Semidalas and Jan M. L. Martin, Canonical and DLPNO-Based G4(MP2)XK-Inspired Composite Wave Function Methods Parametrized against Large and Chemically Diverse Training Sets: Are They More Accurate and/or Robust than Double-Hybrid DFT? J. Chem. Theory Comput. https://doi.org/10.1021/acs.jctc.0c00189 ASAP OPEN ACCESS

作者
Author: sobereva 时间: 2020-6-10 12:01

yflchx 发表于 2020-6-10 10:44
补一篇新发表的文章，里面有些测试比较，另外作者还提出了DLPNO-CCSD(T)取代CCSD(T)，意义不言而喻。

Em ...

这篇文章前几天看了。内容在我来看过于sophisticated，物理化学意义不够清晰
ORCA始终没有提供现成的基于DLPNO衍生的方法的热力学组合方法的脚本，这有碍此方法在热力学量计算上的推广。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-6-10 12:03

雨做的云发表于 2020-6-10 10:21
老师，我想问下对于一个有12个重原子，大概27个原子的结构来说，用M062x/6-311++g(d,p)来做几何优化，用C ...

原理上可以
一般情况下不要给氢加弥散函数
谈谈弥散函数和“月份”基组
http://sobereva.com/119

作者
Author: 雨做的云 时间: 2020-6-10 14:36

sobereva 发表于 2020-6-10 12:03
原理上可以
一般情况下不要给氢加弥散函数
谈谈弥散函数和“月份”基组

嗯嗯，好，我会注意的。谢谢老师

作者
Author: ljh123 时间: 2024-7-21 15:07
sob老师请问下，我想用热力学组合方法算气态能量，但我的结构可能在气相下和溶剂模型下优化差别较大，而热力学组合方法好像都是在气相下优化的。考虑到后面算溶解自由能的模型还得跟热力学组合方法算出来的模型一致，所以能不能在热力学组合方法里加入溶剂模型？如果可以的话怎么加呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-7-23 03:38

ljh123 发表于 2024-7-21 15:07
sob老师请问下，我想用热力学组合方法算气态能量，但我的结构可能在气相下和溶剂模型下优化差别较大，而热 ...

热力学组合方法只能用于算气态热力学数据，没法直接带着溶剂模型算。溶剂效应对热力学量的影响需要另外单算

作者
Author: ljh123 时间: 2024-7-23 18:30

sobereva 发表于 2024-7-23 03:38
热力学组合方法只能用于算气态热力学数据，没法直接带着溶剂模型算。溶剂效应对热力学量的影响需要另外单 ...

我还有个疑惑，算溶解自由能时的结构应该要和算气相高精度单点时的结构一致吧，那比如我用uESE计算溶解自由能时要用B3LYP/Def2tzvp结构优化，那我算气相高精度单点时是必须要用B3LYP/Def2tzvp优化的结构计算吗

作者
Author: sobereva 时间: 2024-7-24 04:40

ljh123 发表于 2024-7-23 18:30
我还有个疑惑，算溶解自由能时的结构应该要和算气相高精度单点时的结构一致吧，那比如我用uESE计算溶解自 ...

不需要一致

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