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标题: Gromacs构建聚合物模型的问题 [打印本页]

作者
Author: 哆啦哆啦 时间: 2018-11-12 14:59
标题: Gromacs构建聚合物模型的问题
各位大佬，最近用gromacs的程序，构建聚合物，单体的力场文件有，该聚合物为AAAAAAAA,请问top 文件是自己手动将参数整合在一起吗？还是有其他办法

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Author: xiaowu759 时间: 2018-11-12 15:08
编辑rtp文件，用pdb2gmx生成即可，具体见GROMACS网上的资料文档

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Author: 哆啦哆啦 时间: 2018-11-12 15:10

xiaowu759 发表于 2018-11-12 15:08
编辑rtp文件，用pdb2gmx生成即可，具体见GROMACS网上的资料文档

有没有资料可以分享一下

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Author: xiaowu759 时间: 2018-11-12 17:25

哆啦哆啦发表于 2018-11-12 15:10
有没有资料可以分享一下

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Author: 哆啦哆啦 时间: 2018-11-12 17:43

xiaowu759 发表于 2018-11-12 17:25
http://www.gromacs.org/Documentation/How-tos/Polymers?highlight=polymer

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