计算化学公社

标题: 前辈们，小型服务器是否需要关闭超线程？ [打印本页]

作者
Author: xiewuhua 时间: 2018-11-17 15:51
标题: 前辈们，小型服务器是否需要关闭超线程？
各位前辈，小生前段时间买了一台小型服务器（2U、24核，系统是Ubuntu16.04 LTS 64位），使用的软件有Gaussian，VASP和FHI-aims，但是感觉运算效率比同样配置的超算中心慢好几倍，是不是超线程的问题，还是并行编译有问题？？

希望前辈能够指点一下。

作者
Author: sobereva 时间: 2018-11-17 16:12
跟超线程没直接关系，关HT是相当多余（而且被以讹传讹）的事情。只要你分配的核数别超过CPU物理核心数就行
仔细看
正确看待超线程(HT)技术对计算化学运算的影响
http://sobereva.com/392

作者
Author: xiewuhua 时间: 2018-11-17 16:14
多谢前辈。

作者
Author: Graphite 时间: 2018-11-17 16:18
0.两台机子，CPU架构、型号是否基本一致？内存是否充裕？对吃I/O的计算，还要考虑硬盘的影响。
1.操作系统、程序版本、编译方式是否一致？
2.计算的对象，资源开销和关键词是否一致？——这个是最大影响。
...
先控制变量，再做测试，不要凭感觉快几倍慢几倍。
正确认识超线程(HT)技术对计算化学运算的影响：http://sobereva.com/392

作者
Author: tiandikuoyuan 时间: 2018-11-17 16:51
是不是CPU频率太低呀，多任务同时运行的时候计算速度也会下降。

作者
Author: sobereva 时间: 2018-11-18 19:36

tiandikuoyuan 发表于 2018-11-17 16:51
是不是CPU频率太低呀，多任务同时运行的时候计算速度也会下降。

跟频率无关。只要确保总调用的核数不超过物理核心数就行。

作者
Author: 韓澤勳 时间: 2019-11-13 20:39

sobereva 发表于 2018-11-18 19:36
跟频率无关。只要确保总调用的核数不超过物理核心数就行。

老师，超算中心的处理器如果支持超线程，软件识别核数翻倍的，那他们会不会按两倍的核时统计呢？花两倍的钱，物理核心只有一个

作者
Author: sobereva 时间: 2019-11-13 21:56

韓澤勳发表于 2019-11-13 20:39
老师，超算中心的处理器如果支持超线程，软件识别核数翻倍的，那他们会不会按两倍的核时统计呢？花两倍的 ...

让使用的程序调用的核数只用物理核心数就完了
如果程序没法改，咨询超算的人

作者
Author: Daniel_Arndt 时间: 2019-11-14 06:45

韓澤勳发表于 2019-11-13 20:39
老师，超算中心的处理器如果支持超线程，软件识别核数翻倍的，那他们会不会按两倍的核时统计呢？花两倍的 ...

软件识别核数翻倍是什么意思？我觉得你完全可以提交一个脚本，里面就执行一个命令“lscpu”，然后自己根据输出中的型号去Intel ARK上查呀。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)