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标题: Gaussianview中如何画出氯离子？？？ [打印本页]

作者
Author: Kellyyyy 时间: 2018-11-17 16:56
标题: Gaussianview中如何画出氯离子？？？
RT

求教怎么在gview中画出氯的离子形式？如下图，想画出一个一氯甲烷分子+一个氯离子作为反应物，使得下面显示出-1charge，现在我只能画出一个一氯甲烷分子+一个氯原子，不能使其带电荷。

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还请高手们指导一下小白啊！！！

作者
Author: 千域小少 时间: 2018-11-17 17:35
本帖最后由千域小少于 2018-11-17 17:47 编辑

体系的可以，也就是实现你说的，下面带-1。写字板打开输入文件，在Title Card Required 下 0 1 改成-1,2 保存。或者gaussview打开results,View/Edit File,修改保存。改的俩个值分别是带电量和自旋多重度

作者
Author: Kellyyyy 时间: 2018-11-18 12:46

千域小少发表于 2018-11-17 17:35
体系的可以，也就是实现你说的，下面带-1。写字板打开输入文件，在Title Card Required 下 0 1 改成-1,2 保 ...

嗯嗯，按照你说的设置了，可以了。谢谢！

但是又出现了一个新的问题：就是我在同一个group下画了两个分子，它们分别是不同的file，其实它们一个是反应物一个是产物，我想模拟出过渡态，在选择计算设置中选不了QST2，我感觉是这两个文件应该合并到一起。不知道要如何实现呢？或者说如何让软件识别这两个一个是反应物，一个是产物呢？

作者
Author: Kellyyyy 时间: 2018-11-18 12:48

如下图所示：

(, 下载次数 Times of downloads: 59)

这两个分子是独立的，Title Card Required 分别显示在两个文件中，应该如何合并呢？

作者
Author: 千域小少 时间: 2018-11-18 16:36

Kellyyyy 发表于 2018-11-18 12:48
如下图所示：

没算过过渡态，不了解，建议你论坛主页谷歌搜索一下

作者
Author: sobereva 时间: 2018-11-18 19:29
如果你非要用QST2不可，用gview的Gaussian calculation setup界面产生QST2的输入文件
反应物和产物就是应当作为一个窗口的两帧出现的。谁是反应物谁是产物无所谓

作者
Author: Kellyyyy 时间: 2018-11-18 19:58

sobereva 发表于 2018-11-18 19:29
如果你非要用QST2不可，用gview的Gaussian calculation setup界面产生QST2的输入文件
反应物和产物就是应 ...

所以应该怎么输入两个分子？不然setup里面QST2就是灰色的没法选。。。

作者
Author: Kellyyyy 时间: 2018-11-18 20:45

千域小少发表于 2018-11-18 16:36
没算过过渡态，不了解，建议你论坛主页谷歌搜索一下

好的谢谢。

对了，那个应该是电荷1，自旋多重度也应该是1.

作者
Author: 千域小少 时间: 2018-11-18 21:33

Kellyyyy 发表于 2018-11-18 20:45
好的谢谢。

对了，那个应该是电荷1，自旋多重度也应该是1.

阴离子是-1，阳离子是1 。。自旋多重度定义为2S+1，其中S是自旋角动量，它与体系内的单电子数(N)相关，S=N/2

作者
Author: granvia 时间: 2018-11-18 23:32

千域小少发表于 2018-11-18 21:33
阴离子是-1，阳离子是1 。。自旋多重度定义为2S+1，其中S是自旋角动量，它与体系内的单电子数(N)相关，S= ...

准确地说S是自旋量子数，是自旋角动量在z方向的分量

作者
Author: sobereva 时间: 2018-11-19 10:10

Kellyyyy 发表于 2018-11-18 19:58
所以应该怎么输入两个分子？不然setup里面QST2就是灰色的没法选。。。

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(, 下载次数 Times of downloads: 69)

作者
Author: Kellyyyy 时间: 2018-11-19 20:24

千域小少发表于 2018-11-18 21:33
阴离子是-1，阳离子是1 。。自旋多重度定义为2S+1，其中S是自旋角动量，它与体系内的单电子数(N)相关，S= ...

好的谢谢！

作者
Author: Kellyyyy 时间: 2018-11-19 20:25

granvia 发表于 2018-11-18 23:32
准确地说S是自旋量子数，是自旋角动量在z方向的分量

哦哦，谢谢！

作者
Author: Kellyyyy 时间: 2018-11-19 20:33

sobereva 发表于 2018-11-19 10:10

感谢！

不过最近又遇到了一个奇怪的问题，才输入一个分子，设置好计算方法提交运行后，很快就弹出严重警告2070.。。。

不知道会有哪些可能的原因造成呢？

作者
Author: Kellyyyy 时间: 2018-11-19 21:46

sobereva 发表于 2018-11-19 10:10

对了大神，能分享一下这个【科音初级量子化学培训班】的相关ppt吗？只要你觉得可以公开的内容，能分享一下吗？

我怕我的问题太多。。。

作者
Author: sobereva 时间: 2018-11-20 11:12

Kellyyyy 发表于 2018-11-19 21:46
对了大神，能分享一下这个【科音初级量子化学培训班】的相关ppt吗？只要你觉得可以公开的内容，能分享一 ...

看此文中的相关条目
北京科音办的培训班FAQ
http://bbs.keinsci.com/thread-5098-1-1.html

作者
Author: sobereva 时间: 2018-11-20 11:12

Kellyyyy 发表于 2018-11-19 20:33
感谢！

不过最近又遇到了一个奇怪的问题，才输入一个分子，设置好计算方法提交运行后，很快就弹出严重 ...

格式不对，或者某些设定有明显错误

给你个例子
(, 下载次数 Times of downloads: 16)

作者
Author: Kellyyyy 时间: 2018-11-20 19:00

sobereva 发表于 2018-11-20 11:12
格式不对，或者某些设定有明显错误

给你个例子

好的谢谢你！

作者
Author: Kellyyyy 时间: 2018-11-20 19:01

sobereva 发表于 2018-11-20 11:12
看此文中的相关条目
北京科音办的培训班FAQ
http://bbs.keinsci.com/thread-5098-1-1.html

嗯嗯好的

作者
Author: 段时间 时间: 2020-6-20 19:44

千域小少发表于 2018-11-18 21:33
阴离子是-1，阳离子是1 。。自旋多重度定义为2S+1，其中S是自旋角动量，它与体系内的单电子数(N)相关，S= ...

请问这里自旋多重度是怎么算的能麻烦细说一下吗，谢谢

作者
Author: tzypla 时间: 2023-11-24 17:40

千域小少发表于 2018-11-17 17:35
体系的可以，也就是实现你说的，下面带-1。写字板打开输入文件，在Title Card Required 下 0 1 改成-1,2 保 ...

请问怎么构建钙离子和磷酸根离子

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-11-24 19:27

tzypla 发表于 2023-11-24 10:40
请问怎么构建钙离子和磷酸根离子

按照http://sobereva.com/620的规定重新问

作者
Author: tzypla 时间: 2023-11-24 20:01

wzkchem5 发表于 2023-11-24 19:27
按照http://sobereva.com/620的规定重新问

你好，我想模拟蛋白质对磷酸根和钙离子的吸附。现在想获得磷酸根和钙离子的pdb文件，请问我怎么获得这两个离子的pdb结构，用gv做出来显示电中性，怎么能在gv中让他们带上电荷。另外怎么获得磷酸根的的top文件

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)