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标题: gaussian新手求助,能量计算与实验矛盾 [打印本页]

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HaythamX    时间: 2018-11-20 01:12
标题: gaussian新手求助,能量计算与实验矛盾
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我用gaussian09对上图中3k与4k进行了构型优化和频率计算(m062x-6-31g(d,p)),4k频率计算的热力学函数结果,吉布斯自由能大概-731a.u.,3k正在构型优化,但我看到G09计算过程中出现的能量大约是-790a.u.,按经验单点能和频率计算里面几个热力学函数差的不大,应该也是这个数量级。60个a.u.的能量差是不是说明这反应没法发生?但实际上这个反应能发生。求助这种体系应该怎么算比较好,是否加了溶剂模型以后会符合实验?




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望月凝香    时间: 2018-11-20 03:56
算能量变化要完整的化学反应式,等号/箭头左右要配平,所有反应物、产物必须都要计算。
你右边氟化产物,左边没有F,来自selectfluor,算了selectfluor没?还有你的boc脱保护的叔丁基变成啥了?
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sobereva    时间: 2018-11-20 10:59
60个a.u.的能量差明摆着是原子数不对应。
只有两个体系,各个元素的原子数都完全一致,能量才有可比性。

另外,凡是溶液环境下的反应,在计算时候,最起码单点要考虑溶剂模型,最好优化时也考虑溶剂模型。

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HaythamX    时间: 2018-11-20 17:45
sobereva 发表于 2018-11-20 10:59
60个a.u.的能量差明摆着是原子数不对应。
只有两个体系,各个元素的原子数都完全一致,能量才有可比性。
...

谢谢sobereva老师。再请问一下,我的selectfluor这个试剂,是一个带两个正电的桥环和两个四氟硼酸根阴负离子,如果要参与计算,应该怎样在gview里搭建模型呢?两个四氟硼酸阴离子应该怎么摆?直接就摆在桥环旁边还是要用虚线和正电荷原子相连?




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