计算化学公社

标题: lammps计算Core-shell模型，能量上移 [打印本页]

作者
Author: 天道无为 时间: 2018-11-20 15:40
标题: lammps计算Core-shell模型，能量上移
大家好，最近我在尝试用lammps做core-shell模型。在npt体系下发现shell部分的运动速度会很快上升（计算了shell部分的温度），能量也在不断升高，即使我已经按照lammps手册上对速度和压强耦合进行了调整。
但是不太确定手册中提到的使用fix momentum使动量为0是对整个体系（all）还是只对core-shell部分使用。
在nve体系下，整个体系的能量也会升高，甚至中断运算。
shell部分的质量我使用的是10%氧原子质量，即1.599，（可能有些重？轻的我也尝试过，同样会出现能量上升的现象）
时间步长使用的是0.4fs，这个步长确实有一点大。我也同样计算了0.1fs的步长结果，同样会有能量上移，shell部分的运动速度也会很快增加，如图，能量单位是kcal/mol，时间步长是0.1fs。
我的体系中氧离子和氢氧根中的氧原子是core-shell模型，铁离子是普通离子模型，力场参考的Surface simulation studies of the hydration of white rust Fe(OH)2, goethite a-FeO(OH) and hematite a-Fe2O3。

向大家请教一下。

谢谢各位。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)