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标题: 请教高斯计算偶极矩结构优化文件和频率计算文件结果不一致问题 [打印本页]

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Author: DUNING 时间: 2018-11-29 15:48
标题: 请教高斯计算偶极矩结构优化文件和频率计算文件结果不一致问题
本帖最后由 DUNING 于 2018-11-29 15:53 编辑

在激发态优化过程中由于软件问题不能opt+freq一起算，只能分开算。先算opt,后计算freq，但在两个结果log文件中偶极矩大小不一致，opt产生的log文件中偶极矩要比freq的log文件大很多，请问是怎么回事？哪个结果才是激发态的偶极矩？
(, 下载次数 Times of downloads: 38) freq.log

(, 下载次数 Times of downloads: 42)
opt.log

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Author: sobereva 时间: 2018-11-29 16:43
用优化完的结构，算单个结构的TDDFT，写诸如TD(root=x) PBE1PBE/6-31G* density，最后给出的偶极矩就是第x激发态的偶极矩

作者
Author: DUNING 时间: 2018-11-29 16:57

sobereva 发表于 2018-11-29 16:43
用优化完的结构，算单个结构的TDDFT，写诸如TD(root=x) PBE1PBE/6-31G* density，最后给出的偶极矩就是第x ...

好的，谢谢sob老师，请问如果是在溶剂当中的话，也是同样的方法吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2018-11-29 23:08

DUNING 发表于 2018-11-29 16:57
好的，谢谢sob老师，请问如果是在溶剂当中的话，也是同样的方法吗？

是。但这是以最简单的方式考虑溶剂对溶质跃迁的响应的做法，还有更复杂、更耗时的特定态模型。

作者
Author: songster 时间: 2018-11-30 09:55
贴出输入文件才能讨论。优化和频率计算最重要的是频率用的是opt最后一步构型且保持关键词一致（除opt和freq外）这样结果才有意义

作者
Author: Changwenxu 时间: 2022-7-15 09:58

sobereva 发表于 2018-11-29 16:43
用优化完的结构，算单个结构的TDDFT，写诸如TD(root=x) PBE1PBE/6-31G* density，最后给出的偶极矩就是第x ...

老师您好，1.如果我算普通全主族前三周期元素小分子的基态偶极矩，能否用B3LYP/6-31G(d）优化完之后，再用PBE0/def2TZVP来算偶极矩？2.如果还想算logP，您推荐什么类型的单点能计算使用基组来算水、辛烷溶剂模型下吉布斯自由能差？望您解惑

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-7-15 15:07

Changwenxu 发表于 2022-7-15 02:58
老师您好，1.如果我算普通全主族前三周期元素小分子的基态偶极矩，能否用B3LYP/6-31G(d）优化完之后，再 ...

1. 可以，但假如分子特别小（比如20个原子以内），建议用大基组做优化，反正也跑得动；假如分子不是特别小，结构优化时必须加色散校正。
2. 按http://sobereva.com/327计算

作者
Author: Changwenxu 时间: 2022-7-15 18:46

wzkchem5 发表于 2022-7-15 15:07
1. 可以，但假如分子特别小（比如20个原子以内），建议用大基组做优化，反正也跑得动；假如分子不是特别 ...

感谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2022-7-16 09:00

Changwenxu 发表于 2022-7-15 09:58
老师您好，1.如果我算普通全主族前三周期元素小分子的基态偶极矩，能否用B3LYP/6-31G(d）优化完之后，再 ...

对偶极矩精度要求高，而且算得动的话，建议用def2-TZVPD
结合SMD的话，用M05-2X/6-31G*，《谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算》（http://sobereva.com/327）里说了

作者
Author: Changwenxu 时间: 2022-7-16 15:39

sobereva 发表于 2022-7-16 09:00
对偶极矩精度要求高，而且算得动的话，建议用def2-TZVPD
结合SMD的话，用M05-2X/6-31G*，《谈谈隐式溶剂 ...

收到！感谢S大

作者
Author: Changwenxu 时间: 2022-7-16 18:34

sobereva 发表于 2022-7-16 09:00
对偶极矩精度要求高，而且算得动的话，建议用def2-TZVPD
结合SMD的话，用M05-2X/6-31G*，《谈谈隐式溶剂 ...

one more question, 算logp想引用您的chemrixv 那篇算C18环的预印，不知道格式是什么？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-7-17 10:04

Changwenxu 发表于 2022-7-16 18:34
one more question, 算logp想引用您的chemrixv 那篇算C18环的预印，不知道格式是什么？

Tian Lu, Qinxue Chen, Zeyu Liu, A Thorough Theoretical Exploration of Intriguing Characteristics of Cyclo[18]carbon: Geometry, Bonding Nature, Aromaticity, Weak Interaction, Reactivity, Excited States, Vibrations, Molecular Dynamics and Various Molecular Properties, ChemRxiv (2019) DOI: 10.26434/chemrxiv.11320130

作者
Author: Changwenxu 时间: 2022-7-18 14:37

sobereva 发表于 2022-7-17 10:04
Tian Lu, Qinxue Chen, Zeyu Liu, A Thorough Theoretical Exploration of Intriguing Characteristics o ...

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