计算化学公社

标题: 高斯计算错误 Problem with coordinate system [打印本页]

作者
Author:
小和尚    时间: 2015-5-22 21:17
标题: 高斯计算错误 Problem with coordinate system
我要优化 水合氢离子(附件),用MP2可以得到结果,但是用DFT方法,B3LYP和MO6-2X优化,都出错误。请问怎么可以解决这个问题,非常感谢
输入文件:

%chk=4H2O+.chk
%mem=1200MB
%nprocshared=4
#p m062x/6-311++g(d,p) 6d opt freq

4H2O+

1 1
O                  0.00164000   -0.00322000   -0.34664000
H                  0.93615900   -0.32524700   -0.13102900
H                 -0.18777600    0.96772000   -0.13178300
H                 -0.74603100   -0.65054500   -0.13038600
O                 -1.88372400   -1.64106100    0.09326700
H                 -2.35818200   -2.08355300   -0.61800300
O                  2.36930900   -0.80104400    0.09412500
H                  2.98469500   -0.99018800   -0.62118900
H                  2.81483800   -0.99065700    0.92510700
H                 -2.26062800   -1.93412500    0.92837600
O                 -0.48765000    2.44620100    0.09346800
H                 -0.63032600    3.07505300   -0.62067200
H                 -0.54933800    2.92453300    0.92582400


输出文件:
(Enter /home/g09root/g09/l701.exe)
Compute integral first derivatives.
... and contract with generalized density number  0.
Leave Link  701 at Fri May 22 16:39:53 2015, MaxMem=  157286400 cpu:       0.3
(Enter /home/qinsong/g09root/g09/l702.exe)
L702 exits ... SP integral derivatives will be done elsewhere.
Leave Link  702 at Fri May 22 16:39:53 2015, MaxMem=  157286400 cpu:       0.0
(Enter /home/g09root/g09/l703.exe)
Compute integral first derivatives, UseDBF=F ICtDFT=           0.
Integral derivatives from FoFDir, PRISM(SPDF).
Calling FoFJK, ICntrl=      2127 FMM=F ISym2X=0 I1Cent= 0 IOpClX= 0 NMat=1 NMatS=1 NMatT=0.
FoFCou: FMM=F IPFlag=           0 FMFlag=      100000 FMFlg1=         800
         NFxFlg=           0 DoJE=F BraDBF=F KetDBF=F FulRan=T
         Omega=  0.000000  0.000000  1.000000  0.000000  0.000000 ICntrl=    2127 IOpCl=  0
         NMat0=    1 NMatS0=    1 NMatT0=    0 NMatD0=    1 NMtDS0=    0 NMtDT0=    0
         I1Cent=           0 NGrid=           0.
Symmetry not used in FoFCou.
Leave Link  703 at Fri May 22 16:39:54 2015, MaxMem=  157286400 cpu:       5.5
(Enter /home/g09root/g09/l716.exe)
Dipole        = 1.17107945D-03-7.01849135D-03 4.18137571D-01
***** Axes restored to original set *****
-------------------------------------------------------------------
Center     Atomic                   Forces (Hartrees/Bohr)
Number     Number              X              Y              Z
-------------------------------------------------------------------
      1        8          -0.000345023    0.000024465    0.000151972
      2        1          -0.000124061    0.000235504    0.000077355
      3        1           0.000156227   -0.000310664   -0.000021876
      4        1           0.000301152    0.000115369   -0.000205702
      5        8           0.000204652    0.000078523   -0.000002895
      6        1          -0.000031721    0.000034844    0.000265423
      7        8          -0.000298557    0.000116560   -0.000205894
      8        1           0.000183406   -0.000107224    0.000078080
      9        1           0.000177490   -0.000097347    0.000070819
     10        1          -0.000236277   -0.000170573   -0.000152666
     11        8           0.000125873   -0.000343366    0.000198128
     12        1          -0.000088503    0.000322194   -0.000105048
     13        1          -0.000024658    0.000101717   -0.000147695
-------------------------------------------------------------------
Cartesian Forces:  Max     0.000345023 RMS     0.000181661
Leave Link  716 at Fri May 22 16:39:54 2015, MaxMem=  157286400 cpu:       0.0
(Enter /home/g09root/g09/l103.exe)

GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Berny optimization.
NTrRot=    -1 NTRed=    28 NAtoms=    13 NSkip=    -5 IsLin=F
Problem with coordinate system.
Error termination via Lnk1e in /home/g09root/g09/l103.exe at Fri May 22 16:39:54 2015.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes 42.8 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=     14 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1


作者
Author:
sobereva    时间: 2015-5-22 21:18
6d是多余的,没任何好处,还会带来数值不稳定性。
写opt=cartesian再试
作者
Author:
小和尚    时间: 2015-5-23 12:56
sobereva 发表于 2015-5-22 21:18
6d是多余的,没任何好处,还会带来数值不稳定性。
写opt=cartesian再试

用这个方法解决了,非常感谢!能请教一下原理吗?谢谢啊
作者
Author:
sobereva    时间: 2015-5-23 21:55
小和尚 发表于 2015-5-23 12:56
用这个方法解决了,非常感谢!能请教一下原理吗?谢谢啊

默认在冗余内坐标下进行,优化有时容易出问题,特别是优化过程中组成二面角的四个原子恰好排成直线,或者组成键角的三个原子组成直线时,优化肯定报错。分子体系还好,团簇优化时这个问题出现得相对频繁。
作者
Author:
jiangxia0909    时间: 2017-3-16 22:17
sobereva 发表于 2015-5-22 21:18
6d是多余的,没任何好处,还会带来数值不稳定性。
写opt=cartesian再试

您好!我优化的是锕系元素的羟基配合物,我也遇到同样的问题,我加了opt=cartesian,输入是
#p b3lyp/genecp 6D 10F SCF=(MaxCyc=1024) Opt=(MaxCyc=1024) Freq=NoRama
n opt=cartesian geom=check guess=read
----------------------------------------------------------------------
但是立马报错说
Illegal IType or MSType generated by parse.
Error termination via Lnk1e in /usr/local/g09/l1.exe
这是怎么回事呢?
作者
Author:
sobereva    时间: 2017-3-16 23:29
jiangxia0909 发表于 2017-3-16 22:17
您好!我优化的是锕系元素的羟基配合物,我也遇到同样的问题,我加了opt=cartesian,输入是
#p b3lyp/g ...

先去掉垃圾关键词再说
常见的多余的和被滥用的Gaussian关键词
http://sobereva.com/331
作者
Author:
jiangxia0909    时间: 2017-3-17 09:55
sobereva 发表于 2017-3-16 23:29
先去掉垃圾关键词再说
常见的多余的和被滥用的Gaussian关键词
http://sobereva.com/331

sob老师,我将多余的关键词去掉了,还是出现了 Error in internal coordinate system.的问题,加了opt=cartesian,输入是 #p b3lyp/genecp Opt Freq opt=cartesian
--------------------------------------
还是提醒Illegal IType or MSType generated by parse.这是怎么回事呢?

作者
Author:
sobereva    时间: 2017-3-17 23:16
jiangxia0909 发表于 2017-3-17 09:55
sob老师,我将多余的关键词去掉了,还是出现了 Error in internal coordinate system.的问题,加了opt=ca ...

上传输入输出文件
opt不要写两遍




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3