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标题: 免费量化软件简介 [打印本页]

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jiangning198511    时间: 2015-5-23 16:02
标题: 免费量化软件简介
伴随着量子化学理论的不断进步和发展,各种量子化学计算程序也不断出现,历史上出现过的程序很多都被人遗忘了,这种情况在免费(开源)软件中更为严重。开源软件的优势是可以根据自己的需要修改相应的源代码以满足研究需要,并且可以节省开支,但缺点是程序经常会出现莫名其妙的错误,也没有丰富的参考资料,只能是自己不断尝试。所以目前国内的计算基本局面是课题组都配备了商业软件如高斯,MOLPRO,MOLCAS等。从效率角度而言使用商业软件是最好的捷径,它为使用者提供丰富的参考资料和完善的售后服务。这里想汇总一些免费(开源)软件的信息,因为有的方法在目前的商业软件中并没有实现,同时,由于其开源性,大家也可以在其基础上构建出自己的计算模块。这里列举的软件信息主要来源于网络,目的在于汇总目前仍在开发的软件。并不代表本人都使用过这些软件,如果在使用这些软件中出现问题,最能帮助你的估计只能是手册了。
1.ORCA
https://orcaforum.cec.mpg.de/
这是德国Frank,Neese大牛领导的程序包,发展非常迅猛,其中对大体系计算有一些独到的方法,非常值得大家学习使用,它的论坛做的非常不错,可以帮助大家解决计算过程中遇到的问题,唯一缺点估计是不提供源代码。不知是不是Neese想做好了商业化, Sob大牛也非常推荐该软件。


2.Cfour
http://slater.chemie.uni-mainz.de/cfour/index.php?n=Main.HomePage
这是德国[size=14.6666669845581px]Jürgen Gauss和美国的[size=14.6666669845581px] [size=14.6666669845581px]John F. Stanton两位CC大牛开发的,主要是使用CC方法的来得到分子性质,下载这个软件需要邮寄申请信到德国。


3.Dirac
http://www.diracprogram.org/doku.php
这个软件的特色集中在相对论方法上,基本上包括了目前流行的相对论方法。


4.GAMESS-US
http://www.msg.ameslab.gov/gamess/gamess.html#
这个软件可以看做是高斯的免费版本,它的目的在于为程序开发者提供一个非常好的开发平台,网站上有专门为程序开发者撰写的指南。


5.Dalton
http://www.daltonprogram.org/
该软件主要集中在分子性质计算,更新速度也非常快,最新版本为2015.这个软件的主要作者就包括了Molecular electronic structure theory(非常值得推荐的书,同时非常难啃)的三位作者。


6.PSI4
http://www.psicode.org/
这个软件主要是面对高精度计算的,软件包括一些特有的方法如Density Cumulant Functional Theory,Orbital-Optimized Post-Hartree-Fock Methods。


希望以上信息对大家有所帮助。欢迎补充




2015-5-23








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yflchx    时间: 2015-5-23 17:20
我记得ORCA手册上说过,ORCA不会收费。

这个软件很好,希望使用的人越来越多。
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jiangning198511    时间: 2015-5-23 18:56
ORCA 论坛中有人问这个程序可否公开源代码,BOSS 说有很多原因导致不能公开,并且目前这种模式是最好的

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sobereva    时间: 2015-5-23 22:11
主流量化程序收费、开源情况:


收费:Gaussian、GAMESS(UK)、Molpro、Turbomole、Spartan、ADF、Q-Chem、DMol3、AMPAC、Hyperchem

免费:Molcas(非官方发布版)、ORCA、GAMESS(US)(开源)、Firefly、NWChem(开源)、Dalton(开源)、PSI4(开源)、Dirac(开源)、CP2K(开源)、MOPAC(7.1及以前开源)、DeMon2K(开源)、ACESII/III(开源)、CFOUR(开源)、Columbus(开源)


PS:这里的开源是指可免费获得代码,而非可以购买源代码
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sobereva    时间: 2015-5-23 22:16
ORCA还一个主要缺点是没图形界面。还有一些功能上的缺点,诸如杂化泛函不支持TDDFT之类。但总的来说,算是免费程序中的高斯了,是没高斯版权的用户做一般性计算的首选。

PSI4,在我来看属于半成品,支持一大堆五花八门的方法,但作为一个成熟量化程序该有的很多特征,比如赝势、找过渡态、溶剂模型等等全都没有,解析Hessian一个也没有。总的来说还是给特殊目的的人用的,优点鲜明,但缺点更多。
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beefly    时间: 2015-5-24 10:14
本帖最后由 beefly 于 2015-5-24 10:16 编辑
sobereva 发表于 2015-5-23 22:11
主流量化程序收费、开源情况:

我感觉“开源”应该是在协议许可的范围内可以自由传播源代码,通常会有一个协议(如GPL、BSD)对此有具体规定。仅仅免费获得源代码并不等于开源。如果我理解的没错的话,Dalton、Dirac、DeMon2K、CFOUR、Columbus就属于这种情况,因为根据申请源代码时签署的协议,一些“开源”行为都是不允许的,例如,把自己申请到的源代码复制给他人或者公开,毕业的学生/离职的博士后保存一份源代码,把源代码移植到自己的程序里,等等,虽然即便这么做了也没人管。



作者
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sobereva    时间: 2015-5-24 10:29
beefly 发表于 2015-5-24 10:14
我感觉“开源”应该是在协议许可的范围内可以自由传播源代码,通常会有一个协议(如GPL、BSD)对此有具体 ...

我这里就是指的经过授权能免费获得源代码而已,和法律角度的开源的确不同。
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smutao    时间: 2015-5-26 05:08
cfour的Jürgen Gauss 是我的同门师兄
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SongChao    时间: 2016-9-23 18:23
sobereva 发表于 2015-5-24 10:29
我这里就是指的经过授权能免费获得源代码而已,和法律角度的开源的确不同。

老师:
      我刚看了molcas@uu主页,意思是这个免费版的molcas,除了没有supporting和源代码,由Uppsala Uppsala大学发布之外,支持的计算和输入文件写法都和付费版的molcas一样吗?
作者
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sobereva    时间: 2016-9-23 20:36
SongChao 发表于 2016-9-23 18:23
老师:
      我刚看了molcas@uu主页,意思是这个免费版的molcas,除了没有supporting和源代码,由Uppsa ...

一样。
作者
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迟晨御龙    时间: 2025-1-30 15:22
sobereva 发表于 2015-5-23 22:11
主流量化程序收费、开源情况:

GAMESS(UK)和GAMESS(US)有何异同与关联?
作者
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sobereva    时间: 2025-1-30 15:31
迟晨御龙 发表于 2025-1-30 15:22
GAMESS(UK)和GAMESS(US)有何异同与关联?

参考北京科音高级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KAQC)讲GAMESS-US的这页幻灯片:
(, 下载次数 Times of downloads: 10)

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nuke    时间: 2025-2-2 13:01
SongChao 发表于 2016-9-23 18:23
老师:
      我刚看了molcas@uu主页,意思是这个免费版的molcas,除了没有supporting和源代码,由Uppsa ...

FALCON Fragments相关东西应该没有




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