计算化学公社

标题: Multiwfn 结合VMD作图的一点问题 [打印本页]

作者
Author: feiteng0427 时间: 2018-12-16 19:45
标题: Multiwfn 结合VMD作图的一点问题
请问：如何将分子显示出来，换句话说，怎么只看分子间的相互作用？

作者
Author: ABetaCarw 时间: 2018-12-16 20:29
卢老师在博文里面写了怎么操作
当然最简单的就是做IGM 分析

作者
Author: feiteng0427 时间: 2018-12-16 20:31
我是初学者能不能说的详细点

作者
Author: ABetaCarw 时间: 2018-12-16 20:34
那你还是做IGM分析吧 http://sobereva.com/407

作者
Author: sobereva 时间: 2018-12-16 23:58
看博文要仔细

使用Multiwfn图形化研究弱相互作用
http://sobereva.com/68

(, 下载次数 Times of downloads: 56)

作者
Author: xaomidaxue 时间: 2018-12-17 10:29

sobereva 发表于 2018-12-16 23:58
看博文要仔细

使用Multiwfn图形化研究弱相互作用

请教一下sobereva老师，初始的xyz文件只能通过分子动力学模拟得到么？比如我想计算有机物的弱相互作用，可否通过ms建立晶胞或者建立无定型胞，然后保存xyz文件通过multiwfn模拟计算分子间的弱相互作用。还是一定要跑分子动力学，因为多分子动力学没有接触过。非常感谢！

作者
Author: feiteng0427 时间: 2018-12-17 10:54

sobereva 发表于 2018-12-16 23:58
看博文要仔细

使用Multiwfn图形化研究弱相互作用

感谢sob老师，问题已经解决。是我自己太大意了。

作者
Author: sobereva 时间: 2018-12-18 03:59

xaomidaxue 发表于 2018-12-17 10:29
请教一下sobereva老师，初始的xyz文件只能通过分子动力学模拟得到么？比如我想计算有机物的弱相互作用， ...

显然不限于分子动力学得到，而且分子动力学得到的仅仅是用于aRDG的目的，对于一般的RDG/IGM分析并不适合
计算程序直接优化的结构转成xyz文件直接就可以用与RDG/IGM

作者
Author: xaomidaxue 时间: 2018-12-18 09:53

sobereva 发表于 2018-12-18 03:59
显然不限于分子动力学得到，而且分子动力学得到的仅仅是用于aRDG的目的，对于一般的RDG/IGM分析并不适合
...

非常感谢老师

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