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标题: 如何在天河二号上安装gaussian09 新手求助 [打印本页]

作者
Author: ad890 时间: 2018-12-22 01:45
标题: 如何在天河二号上安装gaussian09 新手求助
如题，如何在广州天河二号超级计算机上安装高斯09，师兄给我一个在其他平台上可以解压后就运行的，但是不能在天河二号上用，联系客服说需要重新编译。我不知道怎么编译。或者有哪位大神安装过能发个详细教程（包括里面的环境设置等）吗？谢谢。

作者
Author: Mikasa 时间: 2018-12-22 03:05
你问的Gaussian客服还是超算客服？
先参考sob的博文http://sobereva.com/439，看看是不是操作步骤的问题。
要自己编译的话你得有G09的源码以及PGI的编译器，PGI也需要购买（虽然有免费的Community版https://www.pgroup.com/products/community.htm，但对G09来说版本应该太新）。要是有G09的源码的话，里面应该有怎么编译（至少G16版本的按照说明可以很简单的成功编译）。

作者
Author: cokoy 时间: 2018-12-22 09:51
你是用的并行超算云吗？如果是的话，你提供源码客服会找工程师编译。

作者
Author: xaomidaxue 时间: 2018-12-22 10:16
高斯不需要编译，我在天河二号上用过，如果客服不解决，直接说不合作。

作者
Author: sky 时间: 2018-12-23 21:11
1. 放上去设置一下环境变量就能用，我装过。说重新编译的那客服明显不懂，Gaussian还能编译？
2. 天河一个节点24核，跑Gaussian血亏

作者
Author: sky 时间: 2018-12-23 21:13

Mikasa 发表于 2018-12-22 03:05
你问的Gaussian客服还是超算客服？
先参考sob的博文http://sobereva.com/439，看看是不是操作步骤的问题。 ...

Gaussian公开源码吗？居然还能编译

作者
Author: Daniel_Arndt 时间: 2018-12-24 07:21

sky 发表于 2018-12-23 21:13
Gaussian公开源码吗？居然还能编译

我知道国内应该有两个课题组购买了Gaussian源码。但买源码都是为了做一些改动。

作者
Author: yezhonghua 时间: 2018-12-24 10:09

sky 发表于 2018-12-23 21:11
1. 放上去设置一下环境变量就能用，我装过。说重新编译的那客服明显不懂，Gaussian还能编译？
2. 天河一个 ...

事实上还可以，不算亏

作者
Author: ad890 时间: 2018-12-25 17:00

sky 发表于 2018-12-23 21:11
1. 放上去设置一下环境变量就能用，我装过。说重新编译的那客服明显不懂，Gaussian还能编译？
2. 天河一个 ...

你好，我环境变量改错了？你能帮我看看哪里出问题了吗？
slurm.out输出文件是1/WORKSPACE/g09scr:/BIGDATA1/sysu_whhu_1/software/g09:/BIGDATA1/sysu_whhu_1/WORKSPACE/g09scr': not a valid identifier
/tmp/slurmd/job1032374/slurm_script: line 6: yhrun: No such file or directory
/tmp/slurmd/job1032374/slurm_script: line 7: g09: No such file or directory

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