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标题: 求助计算锂电池的电解液体系的总能量是正值正确吗 [打印本页]

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小雨呢喃    时间: 2018-12-24 13:29
标题: 求助计算锂电池的电解液体系的总能量是正值正确吗
本帖最后由 小雨呢喃 于 2018-12-24 13:32 编辑

请问使用amber进行电解液模拟的时候,能量为正值这样正确吗? 电解液成分有机分子 锂离子 硝酸根离子。
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fhh2626    时间: 2018-12-24 14:58
能量的绝对值一般没有任何意义
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小雨呢喃    时间: 2018-12-24 15:07
本帖最后由 小雨呢喃 于 2018-12-24 15:09 编辑
fhh2626 发表于 2018-12-24 14:58
能量的绝对值一般没有任何意义

谢谢回复。也看到一些帖子说 因为总能是成键能和非键能之和,成键能是正值,所以总能可能是正的。只是看这个值好大,就想是不是有问题。
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sobereva    时间: 2018-12-25 00:45
我没用amber跑过你这类体系,不过EELEC这么正,比较诡异
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hdmd    时间: 2018-12-25 14:26
本帖最后由 hdmd 于 2018-12-25 14:30 编辑
小雨呢喃 发表于 2018-12-24 15:07
谢谢回复。也看到一些帖子说 因为总能是成键能和非键能之和,成键能是正值,所以总能可能是正的。只是看 ...

不是这样的,输出结果中非键相互作用能也是正值,库伦作用是正值,以前做过超临界流体的模拟,高压下能量确实大于0,但是这个体系显然不是,难道整个体系不是电中性?实在不行可以考虑把UA力场换个AA力场试一下,这个有点反常规
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小雨呢喃    时间: 2018-12-29 18:23
sobereva 发表于 2018-12-25 00:45
我没用amber跑过你这类体系,不过EELEC这么正,比较诡异

sob老师,谢谢您的回复,刚看到您的回复。这个EELEC是不是有可能由于有机分子之间的相互作用造成的
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小雨呢喃    时间: 2018-12-29 18:24
本帖最后由 小雨呢喃 于 2018-12-29 18:59 编辑
hdmd 发表于 2018-12-25 14:26
不是这样的,输出结果中非键相互作用能也是正值,库伦作用是正值,以前做过超临界流体的模拟,高压下能量 ...

谢谢回复,刚刚看到。 整个体系是电中性的 就是电解液 锂离子 对应的阴离子 有机溶剂。 您能说的详细点吗 过于场
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sobereva    时间: 2018-12-30 04:32
小雨呢喃 发表于 2018-12-29 18:23
sob老师,谢谢您的回复,刚看到您的回复。这个EELEC是不是有可能由于有机分子之间的相互作用造成的

按说阴阳离子间的作用应当使得总静电作用能是明显负值才对。没看到你的具体结构不好说。
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小雨呢喃    时间: 2018-12-30 16:58
sobereva 发表于 2018-12-30 04:32
按说阴阳离子间的作用应当使得总静电作用能是明显负值才对。没看到你的具体结构不好说。

Sob老师,这个是具体的体系,我测试了下静电作用好像主要来自于DME。力场我使用高斯计算然后gaff力场。

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hdmd    时间: 2019-1-8 20:48
小雨呢喃 发表于 2018-12-30 16:58
Sob老师,这个是具体的体系,我测试了下静电作用好像主要来自于DME。力场我使用高斯计算然后gaff力场。

分时间段做下扩散系数,看看平衡没有,如果平衡了应该不要紧
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小雨呢喃    时间: 2019-1-10 21:10
hdmd 发表于 2019-1-8 20:48
分时间段做下扩散系数,看看平衡没有,如果平衡了应该不要紧

好的,谢谢。 扩散系数就是粒子的移动速度吧?




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