计算化学公社

标题: 想学BOMD,有没有大神可以指导一下，或者有什么培训班告知一下？ [打印本页]

作者
Author: nis苯甲酸 时间: 2019-1-3 13:02
标题: 想学BOMD,有没有大神可以指导一下，或者有什么培训班告知一下？

想学BOMD,有没有大神可以指导一下，或者有什么培训班告知一下？
或者有什么资料可以自学一下？
或者有没有什么别的软件有相同的功能？
拜托了！！

作者
Author: sobereva 时间: 2019-1-3 13:32
几个月之后的北京科音高级量子化学培训班里面有一部分专门讲从头算动力学

“别的软件有相同的功能？”问题莫名其妙，你都没说你当前要用的是什么程序
Gaussian、ORCA、GAMESS-US等主流量化程序都支持BOMD，VASP、CP2K等第一性原理程序也都支持BOMD

有问题先想到求助Google，大把的资料，你读都读不完

注意求助帖应当在帖子标题明确体现出“提问”、“求助”及具体内容（见http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html），我已把你的标题“BOMD的使用”改了，望以后注意

作者
Author: nis苯甲酸 时间: 2019-1-3 13:59

sobereva 发表于 2019-1-3 13:32
几个月之后的北京科音高级量子化学培训班里面有一部分专门讲从头算动力学

好的，谢谢您！下次发帖一定注意！我先去自己去查找了解BOMD，然后希望下次培训班可以报上名去深入学习！再次谢谢您百忙之中回复我！

作者
Author: k64_cc 时间: 2019-1-3 17:34
你要学的是MD，除了贼慢之外，BOMD没有任何理论上的特殊性……

作者
Author: nis苯甲酸 时间: 2019-1-16 14:48
本帖最后由 nis苯甲酸于 2019-1-16 14:52 编辑

k64_cc 发表于 2019-1-3 17:34
你要学的是MD，除了贼慢之外，BOMD没有任何理论上的特殊性……

首先谢谢您的热心回复！您说的MD是metadynamics simulations 吗？我是初学者，而且我们组内没有这方面的研究，懂得较少。我想做的是191个水分子组成的水盒子，然后研究在这上面的反应，比如说某一个键长随时间的变化情况。

谢谢您！

作者
Author: sobereva 时间: 2019-1-16 23:29

nis苯甲酸发表于 2019-1-16 14:48
首先谢谢您的热心回复！您说的MD是metadynamics simulations 吗？我是初学者，而且我们组内没有这方面的 ...

MD=molecular dynamics
metadynamics是在MD基础之上的额外技术
你这种体系用诸如VASP、CP2K等都可以跑

作者
Author: nis苯甲酸 时间: 2019-1-18 10:07

sobereva 发表于 2019-1-16 23:29
MD=molecular dynamics
metadynamics是在MD基础之上的额外技术
你这种体系用诸如VASP、CP2K等都可以跑
...

谢谢您百忙之中回复。我一直学的是高斯，老师，高斯可以做下图类似的工作吗？还有，咱们科音有vasp或CP2K的这种培训吗？烦您指教

作者
Author: sobereva 时间: 2019-1-18 14:01

nis苯甲酸发表于 2019-1-18 10:07
谢谢您百忙之中回复。我一直学的是高斯，老师，高斯可以做下图类似的工作吗？还有，咱们科音有vasp或CP2K ...

Gaussian的BOMD和ADMP可以做，免费的ORCA也可以做BOMD，但都不直接支持metadynamics
孤立体系的AIMD属于北京科音高级量子化学培训班的内容（不含metadynamics）
免费的CP2K支持结合metadynamics的BOMD

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