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标题: 求助:amber力场文件各项意义 [打印本页]

作者
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wfmf1994    时间: 2019-1-9 16:26
标题: 求助:amber力场文件各项意义
我最近在学习amber,我想问下:1.amber的力场文件的具体每一项的意义是什么?
2.或者某种工具可以把gromacs的力场文件转换成amber的力场文件?
3.对于gromacs,可以在力场文件里用constraints对某个键长进行约束,对于amber应该怎么去做呢?

先谢过各位了

作者
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sobereva    时间: 2019-1-9 22:04
1 看手册
2 没有。(如果是指拓扑文件转换,可以用https://atb.uq.edu.au/index.py?tab=topology_converter
作者
Author:
wfmf1994    时间: 2019-1-10 14:39
sobereva 发表于 2019-1-9 22:04
1 看手册
2 没有。(如果是指拓扑文件转换,可以用https://atb.uq.edu.au/index.py?tab=topology_converte ...

老师,amber手册里好像并没有类似于gromacs手册第三章那样介绍拓补文件的章节。 在gromacs中,可以做到在拓补文件里用constraints对某个键进行约束,amber在手册里我好像没有找到这样的?




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