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标题: 关于高斯log文件中出现Error: segmentation violation怎么解决 [打印本页]

作者
Author: Lemon- 时间: 2019-1-24 14:56
标题: 关于高斯log文件中出现Error: segmentation violation怎么解决
我的高斯log文件中出现
Error: segmentation violation
rax 0000000000000000, rbx ffffffffffffffff, rcx ffffffffffffffff
rdx 0000000000004ff5, rsp 00007fffae8acd48, rbp 00007fffae8ad320
rsi 000000000000000b, rdi 0000000000004ff5, r8  00002ab2d275dca0
r9  0000000000000000, r10 00007fffae8acad0, r11 0000000000000206
r12 0000000000000000, r13 0000000000000000, r14 00007fffae8ad368
r15 0000000001af0d48
  --- traceback not available
我的输入文件是

%nprocshared=24
%mem=30GB
%chk=re_II_Fe_III_2state_1_Fragmentguess.chk
#p ub3lyp/genecp nosymm pop=always Guess(Fragment=5)

谢谢大神

作者
Author: ABetaCarw 时间: 2019-1-24 16:05
http://bbs.keinsci.com/thread-4829-1-1.html

作者
Author: Lemon- 时间: 2019-1-24 17:32

ABetaCarw 发表于 2019-1-24 16:05
http://bbs.keinsci.com/thread-4829-1-1.html

感谢感谢

作者
Author: xylz6188 时间: 2019-7-12 07:32
楼主你的问题解决了么？

作者
Author: Peter_zhong 时间: 2020-1-6 09:23

xylz6188 发表于 2019-7-12 07:32
楼主你的问题解决了么？

楼主and这位兄弟你的解决了吗，我的出现了

作者
Author: pzl 时间: 2022-6-14 18:26

xylz6188 发表于 2019-7-12 07:32
楼主你的问题解决了么？

这句话是分段错误，
应该是你的开头的核数，内存什么的写错了，或者是安装高斯的时候，Default.Route这个配置的计算资源哪里错了

作者
Author: RES 时间: 2022-7-23 21:34
请问我写的时候没有分配核数和内存，我听其他人说是自动分配最大的核数和内存，我用小分子算的时候也确实是这样子，没有报错，但是算大分子，算了4个小时就报错了这个错，我打开log文件里面也没有细说是什么错误，这样写有什么问题吗？（开头写的是%chk=xxx.chk）

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-7-24 00:18

RES 发表于 2022-7-23 14:34
请问我写的时候没有分配核数和内存，我听其他人说是自动分配最大的核数和内存，我用小分子算的时候也确实是 ...

segmentation violation的报错原因是极其多的，并不是所有segmentation violation都是你楼上提到的原因。还是要结合http://bbs.keinsci.com/thread-4829-1-1.html分析

作者
Author: RES 时间: 2022-7-24 12:25

wzkchem5 发表于 2022-7-24 00:18
segmentation violation的报错原因是极其多的，并不是所有segmentation violation都是你楼上提到的原因。 ...

老师你好，我仔细查看了一下，发现是SCF不收敛的原因导致的，之前我的计算都是在windows下面用Gaussview搭好结构，然后把gjf放到Linux远程进行计算，没有用什么关键词，一直都不会报错，这次我直接在Linux下vi编辑gjf，然后原子坐标用的是Nanotube modeler里面保存出来的坐标，我想的是会不会是Nanotube medeler 里面的原子坐标太过分散，导致不好收敛吗？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-7-24 15:17

RES 发表于 2022-7-24 05:25
老师你好，我仔细查看了一下，发现是SCF不收敛的原因导致的，之前我的计算都是在windows下面用Gaussview ...

那需要你仔细检查你的结构了，Nanotube modeler的原子坐标不是必然过于分散，必须靠你自己检查。
如果结构没有问题，包括原子的单位（埃、Bohr）也没问题的话，按照http://sobereva.com/61的方法依次尝试，把所有方法尝试了、没有遗漏哪怕一个方法，仍然不收敛，再来问

作者
Author: RES 时间: 2022-7-25 22:27
好的，谢谢老师

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