计算化学公社

标题: tinker中mm3力场minimize计算有机分子的最低能量 [打印本页]

作者
Author:
wanglimei    时间: 2019-2-26 13:13
标题: tinker中mm3力场minimize计算有机分子的最低能量
老师:
您好!请教一下用tinker中mm3力场计算有机分子最小能量(minimize)时,由于有机分子中含有吡咯环并且吡咯氮上面连有乙基,所以在计算时会显示angle bending parameters 和Torsional parameters undefined,如图所示,请教老师这种问题需要怎么处理,谢谢老师!

作者
Author:
k64_cc    时间: 2019-2-27 12:19
本帖最后由 k64_cc 于 2019-2-27 12:21 编辑

先弄清楚你缺啥参数再说,真的不想赋这个参数可以把系数填成0,不贡献能量。

不过都用tinker了为啥还用mm3,amoeba不好用吗?




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3