计算化学公社

标题: 关于氢键作用的NCI计算及强弱界定 [打印本页]

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alexwpch    时间: 2019-3-8 07:49
标题: 关于氢键作用的NCI计算及强弱界定
请教一下各位,1. 氢键作用采用NCI计算后给出的3D图形只能通过颜色判断氢键强弱。是否能用sign(λ_2)ρ值来比较强弱(是否同类型才有可比性)。
2. 如果可以的话,采用sign(λ_2)ρ进一步界定强氢键、弱氢键,是否有个明确的分界点?有没有相关文献报道过类似的内容?

作者
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sobereva    时间: 2019-3-8 08:12
1 可以。同类才有可比性。这本质上和用AIM理论里的BCP属性来比较是一码事。Multiwfn里还可以对RDG等值面内区域进行积分来考察,看Multiwfn手册4.200.14节的例子
2 如1所说,这和AIM分析是一码事,用BCP性质进行讨论强弱的文章有的是,诸如J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 11154。
作者
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alexwpch    时间: 2019-3-8 14:39
sobereva 发表于 2019-3-8 08:12
1 可以。同类才有可比性。这本质上和用AIM理论里的BCP属性来比较是一码事。Multiwfn里还可以对RDG等值面内 ...

谢谢sob老师,
再有个附加问题,既然sign(λ_2)ρ值和AIM分析的BCP性质是一码事,为什么BCP有文章给出强弱氢键的界定,而sign(λ_2)ρ值没有呢?因为现在我有个文章,给出RDG的3D图以后,审稿人说,单纯用颜色判断强弱氢键不合理,是否应该有个明确的分界点。我现在想用sign(λ_2)ρ值的大小来界定,但是缺乏相应的文献。难道只能再做个AIM分析吗?
作者
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sobereva    时间: 2019-3-9 03:28
alexwpch 发表于 2019-3-8 14:39
谢谢sob老师,
再有个附加问题,既然sign(λ_2)ρ值和AIM分析的BCP性质是一码事,为什么[/b ...

正因为是一码事,所以你把rho(BCP)的判断标准直接挪到对sign(lambda_2)rho的spike位置上的判断就完了
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alexwpch    时间: 2019-3-9 23:20
sobereva 发表于 2019-3-9 03:28
正因为是一码事,所以你把rho(BCP)的判断标准直接挪到对sign(lambda_2)rho的spike位置上的判断就完了

受教,谢谢sob老师!




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