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标题: 想给一个体系加氢原子钝化,用gview中的加氢工具直接加吗? [打印本页]

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DUNING    时间: 2019-3-13 20:25
标题: 想给一个体系加氢原子钝化,用gview中的加氢工具直接加吗?
想给一个体系加氢原子钝化,用gview的加氢工具直接加,氢原子的位置先用默认的然后再进行结构优化就可以吗?

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sobereva    时间: 2019-3-13 20:57
是的。只要加上去的位置不离谱就不需要再手动调整。
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DUNING    时间: 2019-3-13 21:01
sobereva 发表于 2019-3-13 20:57
是的。只要加上去的位置不离谱就不需要再手动调整。

谢谢老师,但是有一个体系加氢之后再优化,结构变化非常大,这个时候应该怎么办?
作者
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liyuanhe211    时间: 2019-3-14 00:30
DUNING 发表于 2019-3-13 21:01
谢谢老师,但是有一个体系加氢之后再优化,结构变化非常大,这个时候应该怎么办?

要么加氢不合理,要么团簇选取、截断的不合理,要么有些很“活”的团簇边界需要固定。
作者
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DUNING    时间: 2019-3-14 09:27
liyuanhe211 发表于 2019-3-14 00:30
要么加氢不合理,要么团簇选取、截断的不合理,要么有些很“活”的团簇边界需要固定。

好的,谢谢老师,我重新加氢试了一下,这次结构变化不大
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tjx    时间: 2025-5-28 23:23
DUNING 发表于 2019-3-14 09:27
好的,谢谢老师,我重新加氢试了一下,这次结构变化不大

请问是做了什么修改呢?是重新截取的团簇,还是改变了结构优化的方法?谢谢~




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