计算化学公社

标题: 求助用VASP插点时候发现插的点结构有问题 [打印本页]

作者
Author: 逝去难追 时间: 2019-3-15 20:25
标题: 求助用VASP插点时候发现插的点结构有问题
用VASP计算过渡态的时候发现插的点的结构有问题应该怎么解决？是直接将插的结构进行修改还是修改后进行一次优化再把CONTCAR改成POSCAR再进行过渡态的计算
PS：用的是VASP自带的neb INCAR等参数都没问题

作者
Author: 啦啦黑还黑 时间: 2019-3-15 20:37
三种解决方案：
(1)把插好的点的POSCAR下载下来，手动调整好，再覆盖原来的POSCAR
(2)用VTST脚本里的nebavoid.pl避免过短的键
(3)别用nebmake插点，用idpp脚本插点。http://home.ustc.edu.cn/~lipai/s ... ython_idpp_neb.html

作者
Author: 逝去难追 时间: 2019-3-15 20:38

啦啦黑还黑发表于 2019-3-15 20:37
三种解决方案：
(1)把插好的点的POSCAR下载下来，手动调整好，再覆盖原来的POSCAR
(2)用VTST脚本里的neba ...

感谢前辈

作者
Author: 逝去难追 时间: 2019-3-16 09:34

啦啦黑还黑发表于 2019-3-15 20:37
三种解决方案：
(1)把插好的点的POSCAR下载下来，手动调整好，再覆盖原来的POSCAR
(2)用VTST脚本里的neba ...

再请问一下 idpp脚本是像nebmake一样操作吗

作者
Author: didida 时间: 2020-6-8 18:27

啦啦黑还黑发表于 2019-3-15 20:37
三种解决方案：
(1)把插好的点的POSCAR下载下来，手动调整好，再覆盖原来的POSCAR
(2)用VTST脚本里的neba ...

请问我用nebmake.pl插了四个点，但是01和02一直不收敛，00,01,02,03四个构型的能量一直在上升，我舍弃01,02构型，把00(初态),03,04,05(末态)这四个构型继续使用CINEB优化，结构收敛并且验证构型是过渡态的结构，只有一个虚频，这样舍弃其中两个插点得到的结果可用吗？

作者
Author: reductioncat. 时间: 2020-6-11 03:25

didida 发表于 2020-6-8 18:27
请问我用nebmake.pl插了四个点，但是01和02一直不收敛，00,01,02,03四个构型的能量一直在上升，我舍弃01, ...

如果频率和结构是你要找的反应那么可用。做neb目标就是找到TS. 画图也是把IS,TS,FS画上期。其它的点的结构不是必要的，只是帮助你对反应过程分子移动有一个动态认识。

作者
Author: didida 时间: 2020-6-12 12:50

reductioncat. 发表于 2020-6-11 03:25
如果频率和结构是你要找的反应那么可用。做neb目标就是找到TS. 画图也是把IS,TS,FS画上期。其它的点的 ...

嗯恩，谢谢您的回复。但是还有一个小问题，就是我找过渡态用的是低精度(k点：221)，但是我优化初末态构型的时候用的k点是331，用221只是为了先粗略地找过渡态，但是我又用高精度去算就一直没收敛，请问这种情况您有什么见解吗？

作者
Author: 流年2022 时间: 2021-7-22 10:13

reductioncat. 发表于 2020-6-11 03:25
如果频率和结构是你要找的反应那么可用。做neb目标就是找到TS. 画图也是把IS,TS,FS画上期。其它的点的 ...

您好，请问CINEB方法找过渡态时，插的第二个点结构就跑远了，这是什么原因呢？

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