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标题: 新版MaterialsStudio2018在linux系统下用CASTEP计算的时候,是不是不再生成.check [打印本页]

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lindlar    时间: 2019-3-21 15:46
标题: 新版MaterialsStudio2018在linux系统下用CASTEP计算的时候,是不是不再生成.check
本帖最后由 lindlar 于 2019-3-21 15:58 编辑

请问,新版MaterialsStudio2018在linux系统下用CASTEP计算的时候,为什么没有生成.check文件呀?但是我在.castep文件中又发现了Writing model to CsCdVOCl.check这一句话,为什么文件下面没有生成.check文件呢?


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1138711019    时间: 2020-8-18 16:04
同问,我现在计算了没有check文件都不知道怎么计算后面的energy了。

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1138711019    时间: 2020-8-18 17:15
老哥,我知道为啥了,因为你没有在save file 那里点more,里面有一个return complete check file的选项,一定要勾上,MS2018是默认关闭的,完了再生成的file就可以得到check了。
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卡开发发    时间: 2020-8-18 17:17
1138711019 发表于 2020-8-18 16:04
同问,我现在计算了没有check文件都不知道怎么计算后面的energy了。

提交作业是服务器端还是从客户端通过Gateway提到服务器?如果是服务器应该有保存,客户端提交应该在选项卡的job control->more来做一些设置。
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1138711019    时间: 2020-8-18 19:18
卡开发发 发表于 2020-8-18 17:17
提交作业是服务器端还是从客户端通过Gateway提到服务器?如果是服务器应该有保存,客户端提交应该在选项 ...

对的,其实前面两楼都是我。
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卡开发发    时间: 2020-8-18 19:46
本帖最后由 卡开发发 于 2020-8-18 19:49 编辑
1138711019 发表于 2020-8-18 19:18
对的,其实前面两楼都是我。

问题解决了就行。。
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1138711019    时间: 2020-8-19 21:36
卡开发发 发表于 2020-8-18 19:46
问题解决了就行。。

今天算了一天,也测试了一天,发现还是会出现这个没有.check文件的情况,直接计算没有check下的DOS,在体系较小的时候能够算得动,但是一旦体系大起来就会计算很久。查看了cell和param里面的参数没有发现哪里可以更改是否保留check的地方,我估计应该是安装在服务器上的某个配置上有这样的开关吧。无奈,表示不会。
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卡开发发    时间: 2020-8-19 21:53
1138711019 发表于 2020-8-19 21:36
今天算了一天,也测试了一天,发现还是会出现这个没有.check文件的情况,直接计算没有check下的DOS,在体 ...

服务器端直接提交,properties里面的得单独作为一个任务进行提交。原则上,你可以在作业提交的脚本中做处理让计算一次完成。
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1138711019    时间: 2020-8-19 22:01
卡开发发 发表于 2020-8-19 21:53
服务器端直接提交,properties里面的得单独作为一个任务进行提交。原则上,你可以在作业提交的脚本中做处 ...

我试过直接在几何优化后面的properties里面直接勾选DOS,但是计算出来的DOS与单独计算的不太一样,Ef以上会少一截,而且有的峰会有一定的偏差,我把两种计算出来的DOS作差也是发现有数值上的差别的。
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1138711019    时间: 2020-8-19 22:07
卡开发发 发表于 2020-8-19 21:53
服务器端直接提交,properties里面的得单独作为一个任务进行提交。原则上,你可以在作业提交的脚本中做处 ...

而且在Castep.log首行会出现一句话:not keeping all the check files。我估计是服务器上的设置不对。
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卡开发发    时间: 2020-8-20 00:18
1138711019 发表于 2020-8-19 22:01
我试过直接在几何优化后面的properties里面直接勾选DOS,但是计算出来的DOS与单独计算的不太一样,Ef以上 ...

我印象中好像服务器直接算不了DOS,要另外提交,你直接分析DOS大概率可能是用自洽的密度分析的,而没有进行非自洽过程。
作者
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1138711019    时间: 2020-8-20 13:38
卡开发发 发表于 2020-8-20 00:18
我印象中好像服务器直接算不了DOS,要另外提交,你直接分析DOS大概率可能是用自洽的密度分析的,而没有进 ...

大佬,如果我用MS2018计算DOS的时候没有添加.check文件(也没有生成)也算出来了,这个DOS可信吗?
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卡开发发    时间: 2020-8-20 14:46
1138711019 发表于 2020-8-20 13:38
大佬,如果我用MS2018计算DOS的时候没有添加.check文件(也没有生成)也算出来了,这个DOS可信吗?

k点足够密集的情况,如果分析TDOS可以这样。非自洽做DOS性价比比较高,一些点是通过非自洽得来的,另外做PDOS对于CASTEP可能还是得经过这个过程吧?
作者
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1138711019    时间: 2020-8-21 16:50
卡开发发 发表于 2020-8-20 14:46
k点足够密集的情况,如果分析TDOS可以这样。非自洽做DOS性价比比较高,一些点是通过非自洽得来的,另外做 ...

大佬再问一个问题,如果我用gateway提交计算DOS,那个check文件需要自己手动复制到对应文件夹下嘛?还是应该怎么操作呢?
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卡开发发    时间: 2020-8-21 17:02
1138711019 发表于 2020-8-21 16:50
大佬再问一个问题,如果我用gateway提交计算DOS,那个check文件需要自己手动复制到对应文件夹下嘛?还是 ...

手动下载复制到对应目录,或者整个文件夹整个下载。
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lxy770@live.com    时间: 2020-10-29 19:52
卡开发发 发表于 2020-8-21 17:02
手动下载复制到对应目录,或者整个文件夹整个下载。

大佬,想请教一个问题,通过standalone提交到服务器上进行CASTEP结构优化,将check文件导入到PC的算例中,update structure时就会卡住,是电脑的配置问题?没导回check文件,利用castep文件也可以update structure,这样的结构会有什么问题嘛?
作者
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卡开发发    时间: 2020-10-29 22:56
lxy770@live.com 发表于 2020-10-29 19:52
大佬,想请教一个问题,通过standalone提交到服务器上进行CASTEP结构优化,将check文件导入到PC的算例中 ...

这点我不确定castep的structure到底是通过check的信息还是通过castep文件的信息来进行更新的。要判断也不难,你可以针对castep更新的结构核对部分显著变化的原子的坐标。




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