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标题: gromacs中尝试在力场文件中添加成键项报错，请老师指点。 [打印本页]

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Author: Markmahao 时间: 2019-3-28 12:58
标题: gromacs中尝试在力场文件中添加成键项报错，请老师指点。
老师们好，最近需要算一个络合物的分子，想用charmm36力场，但是有些参数ffbonded.itp里面没有，就在文件中添加了下面三段，然后出现了图片中的问题，麻烦老师看看哪里出了问题，还是说从分子拓扑文件开始就完全不对。
CG321 CG323    1 0.15000000 142256.00
OG2D2    NI    1 0.18667500    50000.00
NG301    NI    1 0.19268000    50000.00
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作者
Author: sobereva 时间: 2019-3-28 22:51
碰到报错的时候先着眼解决第一个，找到相应的行看怎么回事。字段顺序不能错

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Author: Markmahao 时间: 2019-3-29 11:35

sobereva 发表于 2019-3-28 22:51
碰到报错的时候先着眼解决第一个，找到相应的行看怎么回事。字段顺序不能错

谢谢sob老师，根据你的指点我解决了大部分问题，现在发现charmm36力场中，不支持CG321和CG323的键连，不知道是不bug，总是提示No default bond types

作者
Author: Emma_Zzz 时间: 2019-11-25 15:25

Markmahao 发表于 2019-3-29 11:35
谢谢sob老师，根据你的指点我解决了大部分问题，现在发现charmm36力场中，不支持CG321和CG323的键连，不 ...

请教一下您，最后具体是怎么改的呢

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