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标题: Gaussian,gview和GaussSum计算拉曼光谱和预共振拉曼光谱的问题 [打印本页]

作者
Author: bingdiaodeleier 时间: 2015-6-11 20:57
标题: Gaussian,gview和GaussSum计算拉曼光谱和预共振拉曼光谱的问题
请教大家几个问题，谢谢大家。

(, 下载次数 Times of downloads: 23)                            图1

(, 下载次数 Times of downloads: 13)
                  图2

1、gaussian计算分子拉曼光谱freq=raman，采用可视化gview打开得到图1，其右纵坐标是散射活性，左纵坐标为Intensity，想请教大家一下，这两个纵坐标的换算公式是什么？图2中的S（公式43）应该是拉曼散射活性，对应的是右纵坐标对吗？图2中公式41是否是这里的左纵坐标？如果是，里面的参数在gview中是怎么个设置法（相应的激发波长，温度等）？

(, 下载次数 Times of downloads: 10)
                           图3

2、在GaussSum中读取相同计算文件（Gaussian的freq=raman后产生的log文件），绘制拉曼谱图，结果和gview的却不太一样，见图3与图1对比，这是为什么？
而且在GaussSum中可以通过设定incident wavelength和temperature来把Raman activity转换成Raman Intensity。这个拉曼强度和实验中有可比性吗？

3、通过TD计算得到分子-金属复合物的吸收光谱，比如第一个最大吸收峰在768.37nm处是一个电荷跃迁态（从金属到分子），那么怎么算这个态下的电荷共振跃迁拉曼光谱呢？高斯中的预共振能用吗？波长如何选择？

3、还是关于高斯中预共振的问题。。。
Gaussian中用Raman和CPHF=Rdfreq连用，计算预共振拉曼光谱，一般预共振拉曼光谱是指没达到共振所需的基态到激发态跃迁的能量，但是也比普通拉曼光谱的达到的虚能级要高是不是？
这样计算的预共振光谱有什么现实意义呢？
如果把预共振拉曼光谱中入射光频率和问题2中的GaussSum中通过设定入射光得到的拉曼强度中的入射光频率设定为一样的，这两种光谱怎么理解区分？

4、共振拉曼里面的什么情况下会增强全对称振动模式？什么情况又会增强全对称振动模式和非全对称振动模式（和振动耦合有关）呢？这个问题有点范范，求点资料。

谢谢大家啦，求指教，或者资料也可。

作者
Author: sobereva 时间: 2015-6-12 01:28
对于gview，坐标轴右侧对应拉曼活性。左侧坐标轴对应基于每个振动的拉曼活性展宽得到的曲线。

拉曼活性和拉曼强度不是一回事。拉曼活性是每个振动模式自身的特征，拉曼强度则取决于温度和激发波长，对每个振动其值正比于拉曼活性。转换关系见Journal of Molecular Structure 702 (2004) 9–21或Chemical Physics Letters 403 (2005) 211–217。

gview里是基于拉曼活性展宽作的图，而严格来说应该是对拉曼强度进行展宽作图。但是gview没法将拉曼活性转换为拉曼强度，但两种结果定性还是相符的，峰的位置相同，但峰高不同。

用Multiwfn 3.3.8(dev)绘制拉曼光谱的时候在作图前可以选择是否先把拉曼活性转换为拉曼强度。

作者
Author: bingdiaodeleier 时间: 2015-6-12 12:28

sobereva 发表于 2015-6-12 01:28
对于gview，坐标轴右侧对应拉曼活性。左侧坐标轴对应基于每个振动的拉曼活性展宽得到的曲线。

拉曼活性 ...

非常谢谢sob老师，拉曼一般采用洛伦兹函数进行展宽吧，那个对每个振动模式进行强度计算公式我看过了，模拟和实验确实很难准确对应啊。关于预共振拉曼光谱的问题还是有些迷糊。

作者
Author: sobereva 时间: 2015-6-12 16:31
是的，分子振动谱都是洛伦兹展宽
强度想对得很准可能不容易，但位置可以对得很准。

预共振、共振拉曼光谱我研究不太多，researchgate上有一些讨论可以看看
https://www.researchgate.net/pos ... an_with_Gaussian_09
https://www.researchgate.net/pos ... unctional_may_I_use

作者
Author: bingdiaodeleier 时间: 2015-6-12 21:45

sobereva 发表于 2015-6-12 16:31
是的，分子振动谱都是洛伦兹展宽
强度想对得很准可能不容易，但位置可以对得很准。

非常感谢sob老师。

作者
Author: ycccc 时间: 2018-12-1 20:12
厉害厉害

作者
Author: sobereva 时间: 2018-12-1 21:14
补充一下，目前Multiwfn可以基于Gaussian的输出文件绘制预共振拉曼光谱，见
使用Multiwfn绘制红外、拉曼、UV-Vis、ECD、VCD和ROA光谱图
http://sobereva.com/224

作者
Author: treeustcer 时间: 2019-7-23 20:54
也就是说gaussview里的Raman光谱就是根据拉曼活性展宽的咯？那么这里的光谱的左侧y轴（intensity）代表着什么呢？intensity和activity之间的转换关系是什么呢？看得出来两者并不是直接的等价关系，而且左侧坐标轴也不是拉曼强度，我带进去上面说的文献里的公式之后也没办法符合（低波数的拉曼强度被过分放大了）

作者
Author: sobereva 时间: 2019-7-24 22:43

treeustcer 发表于 2019-7-23 20:54
也就是说gaussview里的Raman光谱就是根据拉曼活性展宽的咯？那么这里的光谱的左侧y轴（intensity）代表着什 ...

仔细看完这个就明白了
使用Multiwfn绘制红外、拉曼、UV-Vis、ECD、VCD和ROA光谱图
http://sobereva.com/224

严格的拉曼光谱需要用Multiwfn绘制，gview绘制不了

作者
Author: treeustcer 时间: 2019-7-25 10:40
好的，谢谢sob老师！

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