计算化学公社

标题: 如何在GV中,正确设置IR光谱Num Points和Stepsize将数据导出进一步制图? [打印本页]

作者
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zhutuziqin    时间: 2019-3-28 19:21
标题: 如何在GV中,正确设置IR光谱Num Points和Stepsize将数据导出进一步制图?
我已经做的工作:对体系进行了结构优化和频率计算,在GV中查看了IR光谱。
接下来要做的工作:将IR光谱数据导出到Origin作光谱图。

将IR光谱的横坐标单位换成THz后,想要save Data。但是不知道怎么设置Num Points和stepsize才能使导出的数据 在origin上面作的图 最接近于在GV看到的IR光谱图,因为在GV中吸收峰的频率值可以精确到小数点后十位,导出的数据不太可能精确到这么多位,这就存在用origin画出来的图和GV中的IR图在吸收峰上面不能够精确对应并且存在有一定的平移。

遇到的问题:这个平移会对我的整体光谱造成影响吗??有的人说可以将Stepsize设置成傅立叶变换后的频率步进值,0.003052 。  不知道各位老师和同仁们有什么高见?
作者
Author:
sobereva    时间: 2019-3-28 23:02
用Multiwfn绘制光谱是最方便、强大、灵活的,比gview强得多得多得多

使用Multiwfn绘制红外、拉曼、UV-Vis、ECD、VCD和ROA光谱图
http://sobereva.com/224

选择绘制IR后,选14 Multiply the vibrational frequencies by a factor,输入cm-1与THz的转换因子(0.0299792)。然后选8 Input full width at half maximum (FWHM)修改半高宽,设成8*0.0299792。最后设置横坐标范围3 Set lower and upper limit of X-axis,输入比如100,0,-10,然后直接用Multiwfn绘图。如下所示(此时横坐标已经是THz)。也可以导出数据再用Origin绘制
(, 下载次数 Times of downloads: 18)

导出的数据点想要多少就能设多少,settings.ini里改num1Dpoints


“GV中吸收峰的频率值可以精确到小数点后十位”这明显不可能,你看Gaussian输出文件里频率才多少位小数


作者
Author:
zhutuziqin    时间: 2019-3-29 17:28
非常感谢老师的回复和指正,“GV中吸收峰的频率值可以精确到小数点后十位”    是我没有搞清楚在IR光谱上单位从cm^-1转化为THz后可能小数点后面有那么多位,这个和高斯输出文件中的频率值精确位数不是一个概念。 我下来会再仔细研究一下您建议的这个用Multiwfn绘制红外光谱的这几点。  




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