计算化学公社

标题: 进行IRC计算时，为何需要对已有的过渡态结构进行优化？ [打印本页]

作者
Author: jing-quan63 时间: 2019-3-30 13:07
标题: 进行IRC计算时，为何需要对已有的过渡态结构进行优化？
请问各位老师，在进行IRC计算时，为何需要对已有的过渡态结构进行优化？在我看来，所得过渡态原本就是连接两个极小值点（反应物与产物）曲线上的最高点，再对其进行结构优化不是会导致能量降低吗，这样进行IRC分析时怎么能保证他是反应路径上的能量最高点呢？对过渡态再进行结构优化如何保证其只有一个虚频？

作者
Author: Jasminer 时间: 2019-3-30 14:42
问为什么之前先问是不是。
IRC计算不会对过渡态结构再进行优化，不知道你从哪里得知的错误“事实”。

作者
Author: jing-quan63 时间: 2019-3-30 15:03
本帖最后由 jing-quan63 于 2019-3-30 15:04 编辑

Jasminer 发表于 2019-3-30 14:42
问为什么之前先问是不是。
IRC计算不会对过渡态结构再进行优化，不知道你从哪里得知的错误“事实”。

谢谢，因为我在一些文献里看到对反应物、过渡态、产物采用某某方法进行几何优化，并通过IRC分析验证了过渡态正确性，请问这里对过渡态进行几何优化如何理解？过渡态不就是对初始结构进行几何优化得到的吗？

作者
Author: lijiayisjtu 时间: 2019-3-30 16:08
paper里的意思，应该是初猜TS结构或其它方法，优化后得到TS结构，再走IRC，对于IRC两端的结构再进行优化，得到反应物和产物，这样的一个过程

作者
Author: jing-quan63 时间: 2019-3-30 16:51

lijiayisjtu 发表于 2019-3-30 16:08
paper里的意思，应该是初猜TS结构或其它方法，优化后得到TS结构，再走IRC，对于IRC两端的结构再进行优化， ...

好的，谢谢您！我还想问一下，对于同一种反应物，如果存在几个过渡态，那么在进行过渡态搜索时初猜结构只能靠经验么？怎样才能保证找到所有可能的过渡态呢？

作者
Author: granvia 时间: 2019-3-30 19:10

jing-quan63 发表于 2019-3-30 16:51
好的，谢谢您！我还想问一下，对于同一种反应物，如果存在几个过渡态，那么在进行过渡态搜索时初猜结构只 ...

找到所有的过渡态取决于势能面的复杂程度。一般找过渡态需要化学直觉和经验。不过也有一些自动搜索工具，比如这个工作：DOI: 10.1039/C5CP02175H

作者
Author: jing-quan63 时间: 2019-3-30 20:35

granvia 发表于 2019-3-30 19:10
找到所有的过渡态取决于势能面的复杂程度。一般找过渡态需要化学直觉和经验。不过也有一些自动搜索工具， ...

好的，我再看看，谢谢您！

作者
Author: sobereva 时间: 2019-3-31 04:36
注意求助帖必须在帖子标题明确体现出“提问”、“求助”及具体内容（见http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html），我已把你的标题“IRC路径分析”改了，以后请务必注意

仔细看这些了解常识，有了最基本常识自然就不会再问这些问题了。

在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400（http://bbs.keinsci.com/thread-7736-1-1.html）

过渡态、反应路径的计算方法及相关问题
http://sobereva.com/44

简谈Gaussian里找过渡态的关键词opt=TS和QST2、3
http://sobereva.com/460（http://bbs.keinsci.com/thread-12093-1-1.html）

作者
Author: jing-quan63 时间: 2019-3-31 18:38

sobereva 发表于 2019-3-31 04:36
注意求助帖必须在帖子标题明确体现出“提问”、“求助”及具体内容（见http://bbs.keinsci.com/thread-9348 ...

好的，谢谢老师！

作者
Author: lijiayisjtu 时间: 2019-3-31 19:43

jing-quan63 发表于 2019-3-30 16:51
好的，谢谢您！我还想问一下，对于同一种反应物，如果存在几个过渡态，那么在进行过渡态搜索时初猜结构只 ...

opt=TS和QST2、3，前面是用初猜结构进行过渡态的优化，

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)