计算化学公社

标题: opt报错FormBX had a problem [打印本页]

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Author: njuctchem 时间: 2015-6-15 00:31
标题: opt报错FormBX had a problem
使用高斯，做opt时迭代了十几次，出错了。计算中考虑了溶剂化，体系有点大129个原子，6-31G*基组
出错信息如下，不知道是09D没安装好，还是刚买回来的测试版的cpu有问题啊

Using GEDIIS/GDIIS optimizer.
Bend failed for angle 44 - 126 - 122
Tors failed for dihedral 38 - 44 - 126 - 122
Tors failed for dihedral 43 - 44 - 126 - 122
Tors failed for dihedral 120 - 122 - 126 - 44
Tors failed for dihedral 124 - 122 - 126 - 44
Tors failed for dihedral 125 - 122 - 126 - 44
FormBX had a problem.
Error termination via Lnk1e in /home/changyh/gaussian/g09/l103.exe at Sun Jun 14 06:33:44 2015.
Job cpu time: 4 days 23 hours 3 minutes 38.4 seconds.
File lengths (MBytes): RWF= 3263 Int= 0 D2E= 0 Chk= 131 Scr= 1

作者
Author: sobereva 时间: 2015-6-15 01:49
感觉你总是担心你的CPU有问题，完全不是这么回事。不要想太多。
这个问题是因为内坐标在优化过程中出现了问题，你看看最后一帧结构里44-126-122是否成了0或者180度了，以及列出的那几个二面角中的四个原子有没有几乎排成一条直线了。
最简单的解决方法就是用笛卡尔坐标优化，即opt=cartesian。要么就重新定义冗余内坐标来避免出现这种问题，不过这样处理比较麻烦。

作者
Author: njuctchem 时间: 2015-6-15 05:12

sobereva 发表于 2015-6-15 01:49
感觉你总是担心你的CPU有问题，完全不是这么回事。不要想太多。
这个问题是因为内坐标在优化过程中出现了 ...

俺心虚啊，稍有异常，就怕是这个工程版cpu的问题，这几天好紧张
不过经您几次讲解，发现都是别的问题，小的计算也无异常，
应该放心了

作者
Author: play900325 时间: 2016-10-12 21:52

sobereva 发表于 2015-6-15 01:49
感觉你总是担心你的CPU有问题，完全不是这么回事。不要想太多。
这个问题是因为内坐标在优化过程中出现了 ...

老师，我也有这个问题，关键词改成了opt=(cartesian,mod redundant)，但新的错误变成了Cannot AddRedundant with Cartesian or Z-matrix opts。我是需要对坐标做什么修改还是怎么样吗？谢谢老师！

作者
Author: sobereva 时间: 2016-10-12 22:58

play900325 发表于 2016-10-12 21:52
老师，我也有这个问题，关键词改成了opt=(cartesian,mod redundant)，但新的错误变成了Cannot AddRedunda ...

冗余内坐标下优化和笛卡尔坐标下优化是矛盾的。

作者
Author: laoman 时间: 2017-8-15 16:15

sobereva 发表于 2015-6-15 01:49
感觉你总是担心你的CPU有问题，完全不是这么回事。不要想太多。
这个问题是因为内坐标在优化过程中出现了 ...

再麻烦一下Sob老师，这时候是取之前优化出错时的那个有180度角的构象继续优化（用opt=cartesian）还是在原来的输入文件中用opt=cartesian重新优化呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-8-15 20:32

laoman 发表于 2017-8-15 16:15
再麻烦一下Sob老师，这时候是取之前优化出错时的那个有180度角的构象继续优化（用opt=cartesian）还是在 ...

继续优化

作者
Author: laoman 时间: 2017-8-16 20:28

sobereva 发表于 2017-8-15 20:32
继续优化

我猜也是，谢谢Sob老师~

作者
Author: yq1123088 时间: 2018-10-20 23:02

sobereva 发表于 2015-6-15 01:49
感觉你总是担心你的CPU有问题，完全不是这么回事。不要想太多。
这个问题是因为内坐标在优化过程中出现了 ...

Sob老师您好，我也同样出现了这种错误，我直接把opt命令改为opt=cartesian就可以重新优化了么？这两种坐标下的优化结果不会对后面的计算有影响把？还有就是如何把中断的gaussian程序重新接着计算？

作者
Author: sobereva 时间: 2018-10-21 05:26

yq1123088 发表于 2018-10-20 23:02
Sob老师您好，我也同样出现了这种错误，我直接把opt命令改为opt=cartesian就可以重新优化了么？这两种坐 ...

是。不会
怎么恢复中断的任务取决于任务的具体类型以及用的理论方法类型

作者
Author: yq1123088 时间: 2018-10-21 08:03

sobereva 发表于 2018-10-21 05:26
是。不会
怎么恢复中断的任务取决于任务的具体类型以及用的理论方法类型

感谢Sob老师，我的计算任务输入“# opt=cartesian freq b3lyp/genecp scrf=iefpcm”

还有就是我修改用笛卡尔坐标优化后，再次出现了报错，报错信息 (, 下载次数 Times of downloads: 73) 请问这个是表示SCF不收敛的报错吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2018-10-21 14:56

yq1123088 发表于 2018-10-21 08:03
感谢Sob老师，我的计算任务输入“# opt=cartesian freq b3lyp/genecp scrf=iefpcm”

还有就是我修改用 ...

仔细看
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164

写=iefpcm是多余的，本身就是默认的

作者
Author: yq1123088 时间: 2018-10-21 15:12

sobereva 发表于 2018-10-21 14:56
仔细看
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164

好的，谢谢Sob老师

作者
Author: hanmingxi 时间: 2019-5-18 09:27

sobereva 发表于 2018-10-21 14:56
仔细看
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164

sob老师您好，请问我在进行优化的时候先出现了 Optimization stopped.
-- Number of steps exceeded, NStep= 166的报错，通过opt=GDIIS修改后出现 FormBX had a problem.的报错，然后再提取结构用opt=cartesian解决，但之后又出现了 Optimization stopped.的报错，这个时候是要继续提取结构通过opt=GDIIS进行修改还是要尝试其他解决办法？

作者
Author: Mikasa 时间: 2019-5-18 21:39

hanmingxi 发表于 2019-5-18 09:27
sob老师您好，请问我在进行优化的时候先出现了 Optimization stopped.
-- Number of steps exceeded ...

把博文仔仔细细读10遍
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164

作者
Author: hanmingxi 时间: 2019-5-20 09:19

Mikasa 发表于 2019-5-18 21:39
把博文仔仔细细读10遍
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164

您好，我之前看过sob老师的这个帖子，刚也又看了一遍，我的意思是我这种情况是opt=GDIIS没有起作用吗?因为是先出现 Optimization stopped用过之后 FormBX had a problem.才报错然后又用的opt=cartesian，之后又出现Optimization stopped，如果是没有起作用的话再尝试博文的其他方法

作者
Author: sobereva 时间: 2019-5-21 01:58

hanmingxi 发表于 2019-5-20 09:19
您好，我之前看过sob老师的这个帖子，刚也又看了一遍，我的意思是我这种情况是opt=GDIIS没有起作用吗?因 ...

cartesian和gdiis一起用时前者不生效

作者
Author: 佐佐木丶绯世 时间: 2020-9-27 21:41
我跟老哥问题一样

作者
Author: xxzj 时间: 2021-11-24 18:59
本帖最后由 xxzj 于 2021-11-24 19:01 编辑

sobereva 发表于 2015-6-15 01:49
感觉你总是担心你的CPU有问题，完全不是这么回事。不要想太多。
这个问题是因为内坐标在优化过程中出现了 ...

老师，我的分子出现了和上面一样的情况，命令行改为opt=(maxstep=5,Cartesian,Notrust)，继续优化最大位移出现了图片中的情况，想请问一下老师是哪里出现问题了？
(, 下载次数 Times of downloads: 34)

作者
Author: sobereva 时间: 2021-11-25 10:17

xxzj 发表于 2021-11-24 18:59
老师，我的分子出现了和上面一样的情况，命令行改为opt=(maxstep=5,Cartesian,Notrust)，继续优化最大位 ...

没输出文件没法说

作者
Author: KCM@SHU 时间: 2022-10-2 14:06

sobereva 发表于 2015-6-15 01:49
感觉你总是担心你的CPU有问题，完全不是这么回事。不要想太多。
这个问题是因为内坐标在优化过程中出现了 ...

老师出现FormBX had a problem是只可能是结构里面出现0或者180度这类问题吗？因为我加上opt=cartesian之后他还是报错FormBx had a problem的错误了，这时候是只能考虑重新定义冗余内坐标了吗？还是存在其他的可能问题呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-10-2 15:29

KCM@SHU 发表于 2022-10-2 14:06
老师出现FormBX had a problem是只可能是结构里面出现0或者180度这类问题吗？因为我加上opt=cartesian之 ...

8成是你用了gdiis，此时opt=cartesian无效

作者
Author: KCM@SHU 时间: 2022-10-3 13:47

sobereva 发表于 2022-10-2 15:29
8成是你用了gdiis，此时opt=cartesian无效

对的对的，不好意思老师，忘记了这个点，我再算算

作者
Author: xiuyan 时间: 2023-7-3 22:06

hanmingxi 发表于 2019-5-18 09:27
sob老师您好，请问我在进行优化的时候先出现了 Optimization stopped.
-- Number of steps exceeded ...

请问解答了嘛，我也遇到了一样的问题

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