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标题: 求助:MS建模建模问题 [打印本页]

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下午茶    时间: 2019-4-16 16:44
标题: 求助:MS建模建模问题
我从findit晶体数据库中得到了NaYF4的晶体数据,直接在MS里打开配位数是这样的 (, 下载次数 Times of downloads: 57) ,保存成.cif格式再在MS里打开配位数就变了,有知道是什么情况的吗?

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薛定谔猫之谜    时间: 2019-4-17 09:58
在某个坐标点,Na,Y占据的概率相同
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下午茶    时间: 2019-4-17 20:27
薛定谔猫之谜 发表于 2019-4-17 09:58
在某个坐标点,Na,Y占据的概率相同

是的,本来有一个坐标点上Na和Y是一半一半,过了一遍MS后全变成Na了,那这不是改变了晶体得组成了吗?就不是我想要的得那个配位数了,请问您有没有建过这样的模?
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waitingseven    时间: 2019-4-17 20:34
试试用vesta导一下看看,有时候findit09版导出的cif用MS打开会有问题
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薛定谔猫之谜    时间: 2019-4-17 20:43
超胞一下,Na与Y的比例就是1:1了
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下午茶    时间: 2019-4-17 20:48
waitingseven 发表于 2019-4-17 20:34
试试用vesta导一下看看,有时候findit09版导出的cif用MS打开会有问题

用MS打开是没问题的,只是用MS保存后再用MS打开就变了,用VESTA导也是这样,请问您用过Matcloud吗?
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下午茶    时间: 2019-4-17 20:52
薛定谔猫之谜 发表于 2019-4-17 20:43
超胞一下,Na与Y的比例就是1:1了

试了,还是2:1, (, 下载次数 Times of downloads: 55)
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waitingseven    时间: 2019-4-18 09:21
Matcloud没用过,你查看一下初始cif文件里面的原子坐标信息,如果cif文件是Na和Y都是1.5,我觉得可能cif文件里面有三个Na和三个Y的原子坐标信息,而且每两个原子(Na和Y)的位置一样,但是相加得到的occupancy是1
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hit_liaols    时间: 2019-4-18 09:46
Materials Project上貌似有你这个结构
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下午茶    时间: 2019-4-18 09:57
waitingseven 发表于 2019-4-18 09:21
Matcloud没用过,你查看一下初始cif文件里面的原子坐标信息,如果cif文件是Na和Y都是1.5,我觉得可能cif文 ...

是的,这是直接用VESTA打开的图片还有坐标信息 (, 下载次数 Times of downloads: 45) ,这是用MS保存后再用VESTA打开的 (, 下载次数 Times of downloads: 68) ,因为我建好模以后还要在MS里用镧系元素进行掺杂,如果配位数变了,对我掺杂也会有影响吧
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下午茶    时间: 2019-4-18 10:09
hit_liaols 发表于 2019-4-18 09:46
Materials Project上貌似有你这个结构

我没有用过这个,请问这个收费吗?您要是用过这个能不能把NaYF(P6-空间群,六方相的)的晶体数据给我,谢谢啦
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薛定谔猫之谜    时间: 2019-4-18 10:28
本帖最后由 薛定谔猫之谜 于 2019-4-18 10:30 编辑
下午茶 发表于 2019-4-17 20:52
试了,还是2:1,

超胞一下后,4Na, 2Y吧, 你手动将原来概率相同的位点的1个Na改成1个Y,这样就是3Na,3Y了
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下午茶    时间: 2019-4-18 10:43
薛定谔猫之谜 发表于 2019-4-18 10:28
超胞一下后,4Na, 2Y吧, 你手动将原来概率相同的位点的1个Na改成1个Y,这样就是3Na,3Y了

这样也可以吗?可以随意改吗
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薛定谔猫之谜    时间: 2019-4-18 10:54
下午茶 发表于 2019-4-18 10:43
这样也可以吗?可以随意改吗

这个不是随意改,只能改那些概率占据位点。并且,有可能可以改成不止一种。
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492949319    时间: 2019-4-18 12:54
下午茶 发表于 2019-4-18 10:43
这样也可以吗?可以随意改吗

我觉得也要按这位的这样弄,因为你要算掺杂也是要建立超胞,一般没人用虚晶来算。
作者
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下午茶    时间: 2019-4-19 08:15
本帖最后由 下午茶 于 2019-4-19 08:19 编辑
492949319 发表于 2019-4-18 12:54
我觉得也要按这位的这样弄,因为你要算掺杂也是要建立超胞,一般没人用虚晶来算。

好的,我试试,谢谢啦

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下午茶    时间: 2019-4-19 08:20
薛定谔猫之谜 发表于 2019-4-18 10:54
这个不是随意改,只能改那些概率占据位点。并且,有可能可以改成不止一种。

好的,我试试,谢谢啦




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