计算化学公社

标题: 求助packmol不读取我在MS中建模并输出的水分子模型 [打印本页]

作者
Author: 牛很牛 时间: 2019-4-17 09:21
标题: 求助packmol不读取我在MS中建模并输出的水分子模型
现在在做水分子模拟，但是在模拟过程中，packmol开始不读取我在MS中建模并输出的水分子模型，并且说明pdb格式不正确。关键问题是之前还是好好的呀，求哪位大神可以指导一下，然后就是要是有正确格式的水的pdb可以发给我的话，那就非常感谢了。

作者
Author: 晓滨MD 时间: 2019-4-17 10:56
packmol官网的例子里就有水的pdb可以直接下载

作者
Author: sobereva 时间: 2019-4-17 13:01
用gview构建pdb文件，格式与packmol完全兼容。M$在分子结构建模方面比gview差得远

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)